Kirish I bob. Oqsil strukturalarini va uning modellari

OrthoDB https://www.orthodb.org/ Ortologik evolyutsion va funktsional izohlar
neXtProt https://www.nextprot.org/ Inson oqsili ma’lumotlar bazasi
PROSITE https://prosite.expasy.org/ Proteinlar oilasi va domen ma’lumotlar bazasi
STRING https://string-db.org/ Protein-oqsil o‘zaro ta’sir tarmoqlari va boyitish tahlili
UniProtKB https://www.uniprot.org/ Proteinlar ketma-ketligi ma’lumotlar bazasi
ViralZone https://viralzone.expasy.org/ Viruslar haqida ma’lumot varaqlari; ketma-ketlik ma’lumotlar bazalari bilan bog‘langan.
ENZYME https://enzyme.expasy.org/ Ferment nomenklaturasi bazasi
HAMAP https://hamap.expasy.org/ UniProtKB oilasi tasnifi va izohi
MyHits https://myhits.sib.swiss/ Protein ketma-ketligi va motivlar o‘rtasidagi munosabatlar
SwissLipids https://www.swisslipids.org/#/ Lipidlar bo‘yicha ma’lumot manbai
VenomZone https://venomzone.expasy.org/ Zahar oqsili portali UniProtKB/Swiss-Prot yozuvlari
9-rasmda qidiruv maydoniga kirish sifatida «COVID-19» bilan olingan natija sahifasi ko‘rsatilgan. Ushbu sahifa ikki qismdan iborat:

9-rasm. Expasy natijalar sahifasi: qidiruv natijalarining ikki turi vizual ravishda ajratilgan. 1. (Yuqori) Resurslararo qidiruv natijasi; 19 ma’lumotlar bazasining har birida topilgan xitlar soni bilan; 2. (pastki) Muntazam qidiruv.
Yuqori: manbalar o‘rtasidagi qidiruv natijasi (to‘liq matn rejimi)
Pastki: oddiy qidiruv natijasi (resurs nomlari, kalit so‘zlar, toifalar va tavsiflar).
Yuqoridagi misolda manbalar o‘rtasidagi qidiruv “COVID-19” Cellosaurusva UniProtKB-dagi 3078 ta yozuvda ikkita yozuvda topilganligini ko‘rsatadi. Xitlar sonini bosish orqali foydalanuvchi tegishli ma’lumotlar bazalaridagi so‘rov natijalariga yo‘naltiriladi.Natija qaytarilmasa (masalan, format qo‘llab-quvvatlanmasa yoki resurs serveri vaqtincha ishlamay qolsa), xato belgisi natijalar sonini almashtiradi (9-rasm, yuqoridagi rasmga qarang). Muntazam qidiruv shuni koʻrsatadiki, PROSITE, SWISS-MODEL Repository, ViralZone, Nextstrain, GlyConnect, SIB COVID-19 Integrated Knowledge Base (https://covid-19-sparql) kabi 19 ta manba COVID-19 bilan bogʻliq.