Kurs ishi mavzu: biologik ketma-ketliklarni taqqoslash asoslari

To'liq genomlarning ketma-ketligi

5.386 bp genom bakteriofag φX174. Har bir rangli blok genni anglatadi.

Birinchi DNK genomining ketma-ketligi shu edi bakteriofag φX174 1977 yilda. Tibbiy tadqiqotlar kengashi olimlar DNKning to'liq ketma-ketligini ochib berishdi Epstein-Barr virusi 1984 yilda uni topish 172,282 nukleotidni o'z ichiga olgan. Ketma-ketlikning tugashi DNKning ketma-ketlikda muhim burilish nuqtasini ko'rsatdi, chunki u virus haqida oldindan genetik profil ma'lumotiga ega bo'lmagan.

Elektroforez paytida reaksiya aralashmalarini ketma-ketligi DNK molekulalarini immobilizatsiya qiluvchi matritsaga o'tkazish uchun radioaktiv bo'lmagan usul Poxl va uning hamkasblari tomonidan 80-yillarning boshlarida ishlab chiqilgan. Keyinchalik, "Direct-Blotting-Electrohoresis-System GATC 1500" DNK sekvensiyasining tijoratlashtirilishi GATC Biotech, bu Evropa Ittifoqi genomini ketma-ketlashtirish dasturi, xamirturushning to'liq DNK ketma-ketligi doirasida intensiv ishlatilgan Saccharomyces cerevisiae II xromosoma Leroy E. Gudlaboratoriyasi Kaliforniya texnologiya instituti birinchi yarim avtomatlashtirilgan DNK sekvensiya mashinasini 1986 yilda e'lon qildi. Buning ortidan Amaliy biosistemalar1987 yilda va Dyupontning Genesis 2000 tomonidan ishlab chiqarilgan birinchi to'liq avtomatlashtirilgan sekvensiya mashinasi ABI 370 ning marketingi to'rtta dideoksinukleotidni bitta qatorda aniqlashga imkon beradigan yangi lyuminestsent yorliqlash texnikasidan foydalangan. 1990 yilga kelib AQSh Milliy sog'liqni saqlash institutlari (NIH) keng ko'lamli ketma-ketlik sinovlarini boshlagan edi Mycoplasma capricolum, Escherichia coli, Caenorhabditis elegansva Saccharomyces cerevisiae har bir baza uchun 0,75 AQSh dollaridan. Ayni paytda, insonning ketma-ketligi cDNA deb nomlangan ketma-ketliklar ifodalangan ketma-ketlik teglari yilda boshlandi Kreyg Venterning laboratoriya, ning kodlash qismini olish uchun urinish inson genomi. 1995 yilda Venter, Xemilton Smitva uning hamkasblari Genomik tadqiqotlar instituti (TIGR) erkin tirik organizmning birinchi to'liq genomini - bakteriyani nashr etdi Gemofilus grippi. Dairesel xromosoma 1.830.137 asosini va Science jurnalida nashr etilishini o'z ichiga oladi butun genomli ov miltig'ini ketma-ketligini birinchi marta nashr etilganligini belgilab, xaritalarni dastlabki xaritalashga ehtiyojni yo'q qildi.
2001 yilga kelib, odam genomining qoralama ketma-ketligini ishlab chiqarish uchun ov miltig'ini tartiblash usullari ishlatilgan.