Kurs ishi mavzu: biologik ketma-ketliklarni taqqoslash asoslari

To'rt kanonik asos
DNKning kanonik tuzilishi to'rt asosga ega: timin (T), adenin (A), sitozin (C) va guanin (G). DNK sekvensiyasi - bu DNK molekulasidagi ushbu asoslarning fizik tartibini aniqlash. Ammo, molekulada mavjud bo'lishi mumkin bo'lgan boshqa ko'plab asoslar mavjud. Ba'zi viruslarda (xususan, bakteriyofag), sitozin o'rnini gidroksi metil yoki gidroksi metil glyukoza sitozin bilan almashtirish mumkin.Sutemizuvchilarning DNKlarida, bilan variantli asoslar metil guruhlar yoki fosfosulfat topish mumkin. Sekvensiya texnikasiga qarab, ma'lum bir modifikatsiya, masalan, 5mC (5 metil sitozin) odamlarda keng tarqalgan, aniqlanishi mumkin yoki bo'lmasligi mumkin.
RNK ketma-ketligi
RNK ketma-ketligi nukleotidlar sekvensiyasining dastlabki shakllaridan biri bo'lgan. RNK sekvensiyasining asosiy belgisi bu birinchi to'liq gen va to'liq genomning ketma-ketligi Bakteriyofag MS2tomonidan aniqlangan va nashr etilgan Valter Feyers va uning hamkasblari Gent universiteti (Gent, Belgiya), 1972 yilda va 1976 yil. An'anaviy RNK sekvensiyalash usullari yaratishni talab qiladi cDNA ketma-ket bo'lishi kerak bo'lgan molekula.
DNKning dastlabki sekvensiya usullari
DNK ketma-ketliklarini aniqlashning birinchi usuli tomonidan belgilanadigan joyga xos primer kengayish strategiyasi kiritilgan Rey Vu da Kornell universiteti 1970 yilda DNK polimeraza katalizi va o'ziga xos nukleotid markirovkasi, ularning ikkalasi ham hozirgi sekvensiya sxemalarida katta ahamiyatga ega bo'lib, lambda fag DNKning uyg'un uchlarini ketma-ketlikda ishlatilgan. 1970 yildan 1973 yilgacha Wu, R Padmanabhan va uning hamkasblari ushbu usulni sintetik joylashuvga xos primerlar yordamida har qanday DNK ketma-ketligini aniqlash uchun qo'llash mumkinligini isbotladilar. Frederik Sanger keyin DNKning tezkor tartibini tezroq ishlab chiqish uchun ushbu primer-kengaytma strategiyasini qabul qildi MRC markazi, Kembrij, Buyuk Britaniya va 1977 yilda "zanjir bilan tugaydigan inhibitorlar bilan DNK sekvensiyasi" uslubini nashr etdi. Valter Gilbert va Allan Maksam da Garvard shuningdek sekvensiya usullari ishlab chiqilgan, shu jumladan "DNKning kimyoviy parchalanishi bilan sekvensiyasi". 1973 yilda Gilbert va Maksam "sayr-nuqta tahlillari" deb nomlanuvchi usuldan foydalangan holda 24 taglik qator haqida xabar berishdi.[36] Birgalikda rivojlanish yordam berdi rekombinant DNK DNK namunalarini viruslardan boshqa manbalardan ajratishga imkon beruvchi texnologiya.