Kurs ishi mavzu: Filogenetikaning asosiy tushunchalari

Ildizli daraxtni tahrirlash

Ildizli filogenetik daraxt (yuqoridagi ikkita rasmga qarang) daraxt barglaridagi barcha mavjudotlarning (odatda hisoblangan) eng so'nggi umumiy ajdodiga mos keladigan noyob tugunga - ildizga ega bo'lgan yo'naltirilgan daraxtdir. Ildiz tugunning asosiy tuguniga ega emas, lekin daraxtdagi barcha boshqa tugunlarning ota-onasi bo'lib xizmat qiladi. Shuning uchun ildiz 2-darajali tugundir, boshqa ichki tugunlar esa minimal 3 darajaga ega (bu erda "daraja" kiruvchi va chiquvchi qirralarning umumiy sonini bildiradi).
Daraxtlarni ildiz otishning eng keng tarqalgan usuli bu qarama-qarshi guruhdan foydalanish - xarakterli ma'lumotlardan yoki molekulyar ketma-ketlikdan xulosa chiqarishga imkon beradigan darajada yaqin, ammo aniq tashqi guruh bo'lish uchun etarlicha uzoq.

Ildizsiz daraxtni tahrirlash

Ildizsiz daraxtlar, ajdodlar haqida taxmin qilmasdan, barg tugunlarining o'zaro bog'liqligini ko'rsatadi. Ular ajdodlar ildizini bilish yoki xulosa chiqarishni talab qilmaydi. Ildizsiz daraxtlar har doim ildizni tashlab ketish orqali ildiz otgan daraxtlardan yaratilishi mumkin. Aksincha, ildizi bo'lmagan daraxtning ildizi haqida xulosa chiqarish ajdodlarni aniqlashning ba'zi usullarini talab qiladi. Bu, odatda, kirish ma'lumotlariga tashqi guruhni kiritish orqali amalga oshiriladi, shunda ildiz majburiy ravishda daraxtdagi tashqi guruh va taksonlarning qolgan qismi o'rtasida bo'ladi yoki har bir filialda evolyutsiyaning nisbiy sur'atlari haqida qo'shimcha taxminlar kiritiladi, masalan, ilova. molekulyar soat gipotezasi.

Ikki yoki ko'p qirrali tahrirlash

Ildizli va ildizsiz daraxtlar ikki yoki ko'p qirrali bo'lishi mumkin. Ildizli ikkilamchi daraxtning har bir ichki tugundan kelib chiqadigan roppa-rosa ikkita avlodi (ya’ni ikkilik daraxtni hosil qiladi) va ildizi yo‘q ikkilik daraxt shaklini oladi, har bir ichki tugunda roppa-rosa uchta qo‘shni bo‘lgan erkin daraxt. Bundan farqli o'laroq, ildizli ko'p qirrali daraxtning ba'zi tugunlarida ikkitadan ortiq bolasi bo'lishi mumkin va ildizi yo'q ko'p qirrali daraxtning ba'zi tugunlarida uchtadan ortiq qo'shni bo'lishi mumkin.