Kurs ishi mavzu: Genomika va Proteomika. Bajardi: Komilova M. Qabul qildi : Do'sov X. Urganch-2023 Reja

Funktsional genomikani tushunish uchun avval funktsiyani aniqlash muhim ahamiyatga ega. Ularning qog'ozida Graur va boshq. funktsiyani ikkita mumkin bo'lgan usulda aniqlang. Bular "Tanlangan effekt" va "Sababiy roli". "Tanlangan effekt" funktsiyasi uchun xususiyat (DNK, RNK, oqsil va boshqalar) tanlangan funktsiyani anglatadi. "Sababiy roli" funktsiyasi bu xususiyat etarli va zarur bo'lgan funktsiyani anglatadi. Funktsional genomika odatda funktsiyani "Sababli rol" ta'rifini sinovdan o'tkazadi.
Funktsional genomika tomonidan yaratilgan keng ma'lumotlardan foydalaniladi genomik va transkriptomik loyihalar (masalan genomlarni tartiblashtirish bo'yicha loyihalar va RNK ketma-ketligi). Funktsional genomika gen kabi dinamik jihatlarga e'tibor beradi transkripsiya, tarjima, gen ekspressionini tartibga solish va oqsil va oqsillarning o'zaro ta'sirikabi genomik ma'lumotlarning statik jihatlaridan farqli o'laroq DNK ketma-ketligi yoki inshootlar. Funktsional genomika tadqiqotlarining asosiy xarakteristikasi ularning ushbu savollarga genomika bo'yicha yondoshishidir, odatda an'anaviy genlar bo'yicha genga emas, balki yuqori samaradorlik usullarini o'z ichiga oladi.
Qiyosiy Genomika - bu maydon biologik tadqiqotlar, unda taqqoslash genomik turli xil xususiyatlar organizmlar. Genomik xususiyatlar quyidagilarni o'z ichiga olishi mumkin DNK ketma-ketligi , genlar , genlar tartibi , tartibga solish ketma-ketligi va genomning boshqa strukturaviy belgilari. Bu sohada genomikalar taqqoslash natijada olingan genomlarning butun yoki katta qismlari genomik loyihalar , asosiy biologik o'xshashliklar va farqlarni o'rganish uchun evolyutsion organizmlar o'rtasidagi munosabatlar. Qiyosiy genomikaning asosiy printsipi shundaki, ikki organizmning umumiy xususiyatlari ko'pincha kodlangan DNK, qaysi evolyutsion saqlanadi ularning orasida. Shunday qilib, qiyosiy genomik yondashuvlar ba'zi shakllarni bajarish bilan boshlanadi hizalama genom va qidiruv ketliklar ortolog ketliklar (ketma-ketliklar bor umumiy kelib chiqishi ) hizalanan genomlarda va bu ketma-ketliklar qanchalik darajada davom etayotganini tekshiring.
Deyarli bir marta boshlangan 1995 yil ichida ikki organizmlarning to'liq genomlari (ya'ni bakteriyalar genomlari) mavjud bo'ldi Haemophilus influenzae va Mycoplasma genitalium ) qiyosiy Genomika endi har bir yangi genom ketma-ketligini tahlil qilishning standart komponentidir. Raqamning keskin o'sishi bilan bog'liq genomik loyihalar yutuqlar tufayli texnologiyalar DNK tartiblash , ayniqsa usullari keyingi avlod tartiblash 2000-yillarning oxirida, bu maydon ko'p genomları bilan shug'ullanish uchun ruxsat, yanada murakkab aylandi. bir tadqiqotda. Qiyosiy Genomika yaqin aloqador organizmlar o'rtasidagi o'xshashlikning yuqori darajasini aniqladi odamlar va shimpanzeler . va bundan ham ajablanarli tomoni shundaki, odamlar va xamirturush kabi uzoqdan bog'liq bo'lgan organizmlar o'rtasidagi o'xshashlik Saccharomyces cerevisiae . Shuningdek, u turli evolyutsion yo'nalishlarda gen tarkibining juda xilma-xilligini ko'rsatdi.