83
ет 5
′-концевые гидроксильные группы ДНК и РНК (3′-группы не фос-
форилируются). Этот фермент часто используется в ГИ для мечения
5
′-конца нуклеотидной цепи с помощью радиоактивного
32
Р. Последо-
вательное действие фосфатазы и полинуклеотидкиназы
приводит к
замещению немеченого 5
′-концевого фосфомоноэфира на радиоак-
тивный без других изменений в цепи.
Лигазы. При получении гибридных
молекул ДНК требуется объ-
единение
in vitro сегментов ДНК из различных источников. Лигазы как
раз и осуществляют ковалентное сшивание фрагментов ДНК путем обра-
зования фосфодиэфирных связей между соседними нуклеотидами. Для
этого в большинстве случаев требуется отжиг цепей с комплементарными
«липкими» концами.
Однако лигаза, кодируемая фагом Т4, способна с
невысокой эффективностью лигировать «тупые» концы ДНК.
ДНК-полимеразы. Они описаны в подразд. 1.1. Из них в ГИ чаще
всего используют Роl-I. С ее помощью, например, фрагменты с «лип-
кими» концами превращают во фрагменты с «тупыми» концами.
Терминальная дезоксинуклеотидилтрансфераза. Этот фермент
полимеризует нуклеотиды, не используя никаких матриц, а в осталь-
ном он похож на ДНК-полимеразы. С его помощью можно, например,
к молекулам ДНК, не имеющим «липких» концов,
присоединить та-
кие концы. В частности, если большие
молекулы ДНК продавливать
через сито или энергично перемешивать раствор,
происходят много-
численные ее разрывы с образованием «тупых» концов. Если к одно-
му набору фрагментов присоединить poly(dT), а к другому – poly(dA)
и смешать эти фрагменты, то произойдет их
соединение друг с дру-
гом. Пробелы, образующиеся из-за неравной длины хвостов,
могут
быть заполнены Роl-I, а концы сшиты лигазой. Такой подход исполь-
зовался при конструировании первой гибридной молекулы ДНК.
Кроме этого, инструментами ГИ являются векторные ДНК, кото-
рые будут рассмотрены позже совместно с технологией создания гиб-
ридных ДНК.
Do'stlaringiz bilan baham: