Molekulyar filogenetika

16.3.1. Filogenetik daraxtlardan foydalanishga misollar
Birinchidan, biz zamonaviy molekulyar biologiyada an'anaviy daraxt rekonstruktsiyasidan foydalanishning turli usullarini ko'rsatadigan ikkita loyihani ko'rib chiqamiz.
DNK filogenetikasi odamlar va boshqa primatlar o'rtasidagi evolyutsion munosabatlarga aniqlik kiritdi
Darvin (1871 ) odamlar va boshqa primatlar oʻrtasidagi evolyutsion munosabatlar haqida fikr yuritgan birinchi biolog edi. Uning fikri - odamlar shimpanze, gorilla va orangutan bilan chambarchas bog'liq - bu birinchi marta taklif qilinganida bahsli edi va keyingi o'n yilliklarda hatto evolyutsionistlar orasida ham yoqmadi. Haqiqatan ham, biologlar hayvonot dunyosidagi o'rnimizga antropotsentrik qarashning eng qizg'in tarafdorlari edi ( Godman, 1962 ).
Fotoalbomlarni o'rganish natijasida paleontologlar 1960 yilgacha shimpanze va gorillalar bizning eng yaqin qarindoshlarimiz degan xulosaga kelishgan, ammo munosabatlar uzoq bo'lib, bir tomondan odamlarga, ikkinchi tomondan shimpanze va gorillalarga olib kelgan bo'linish 15 million yil davomida sodir bo'lgan. oldin. 1960-yillarda immunologik tadqiqotlar natijasida olingan birinchi batafsil molekulyar ma'lumotlar ( Godman, 1962 ; Sarich va Wilson, 1967 ) odamlar, shimpanzelar va gorillalar haqiqatan ham bitta to'da hosil qilishini tasdiqladi ( 16.2 -bandga qarang).) lekin munosabatlar ancha yaqinroq ekanligini taklif qildi, molekulyar soat bu bo'linish faqat 5 million yil oldin sodir bo'lganligini ko'rsatadi. Bu filogenetik ma'lumotlarga molekulyar soatni qo'llash bo'yicha birinchi urinishlardan biri edi va natija, tabiiyki, qandaydir shubha bilan qaraldi. Haqiqatan ham, fotoalbom dalillarida ko'rsatilgan qadimiy bo'linishga ishongan paleontologlar va molekulyar ma'lumotlar tomonidan taklif qilingan so'nggi sanaga ko'proq ishongan biologlar o'rtasida keskin munozaralar boshlandi. Bu munozarada molekulyar biologlar g'alaba qozonishdi, ularning bo'linish taxminan 5 million yil oldin sodir bo'lgan degan qarashlari umumiy qabul qilindi.

16.2-band
Molekulyar filogenetik terminologiya. Matn molekulyar filogenetikada ishlatiladigan ko'pgina muhim atamalarning ta'riflarini o'z ichiga oladi. Ushbu mavzu bo'yicha tadqiqot maqolalarini o'qiyotganda foydali bo'lishi mumkin bo'lgan bir nechta qo'shimcha ta'riflar: Operatsion (batafsil...)
Borgan sari ko'proq molekulyar ma'lumotlar olindi, odamlar, shimpanzelar va gorillalar paydo bo'lishiga olib kelgan evolyutsion hodisalarning aniq naqshini o'rnatishdagi qiyinchiliklar aniq bo'ldi. Uch turning mitoxondrial genomlarini cheklash xaritasi ( 5.3.1-bo'lim ) va DNK ketma -ketligi bilan taqqoslash shuni ko'rsatdiki, shimpanze va gorilla odamlarga qaraganda bir-biri bilan chambarchas bog'liq ( 16.14A-rasm ), DNK-DNK gibridizatsiyasi esa. ma'lumotlar odamlar va shimpanzelar o'rtasidagi yaqinroq munosabatlarni qo'llab-quvvatladi ( 16.14B-rasm ). Ushbu qarama-qarshi natijalarning sababi uchta turdagi DNK ketma-ketligi o'rtasidagi yaqin o'xshashlikdir, farqlar hatto genomlarning eng xilma-xil hududlari uchun ham 3% dan kam.15.4-bo'lim ). Bu aniq munosabatlarni o'rnatishni qiyinlashtiradi.

16.14-rasm
Odamlar, shimpanzelar va gorillalar o'rtasidagi evolyutsion munosabatlarning turli talqinlari. Tafsilotlar uchun matnga qarang. Qisqartma: Myr, million yil.
Muammoni hal qilish imkon qadar ko'p turli xil genlar o'rtasida taqqoslash va eng ko'p o'xshashlikni ko'rsatishi kutilayotgan o'sha lokuslarni maqsad qilib qo'yish edi. 1997 yilga kelib, 14 xil molekulyar ma'lumotlar to'plami, jumladan, psevdogenlar va kodlanmagan ketma-ketliklar ( Ruvolo, 1997 ) kabi o'zgaruvchan lokuslar ketma-ketligi olindi. Ushbu ma'lumotlar to'plamining tahlili shimpanzening odamlarga eng yaqin qarindoshi ekanligini tasdiqladi, bizning nasllarimiz 4,6-5,0 million yil oldin ajralib chiqqan. Gorilla bir oz uzoqroq qarindosh bo'lib, uning nasl-nasabi 0,3-2,8 million yil avval inson shimpanzidan ajralib chiqqan ( 16.14C-rasm ).