Molekulyar filogenetika

16.13-rasm
Insonning molekulyar soatini hisoblash. O'zgartirishlar soni inson va orangutanning bir juft homolog genlari uchun aniqlanadi: bu raqamni "x" deb nomlang. Shunday qilib, har bir nasl uchun almashtirishlar soni ^x / ₂ ga teng, va har bir nasl uchun (ko'proq...)
Bir vaqtlar barcha organizmlardagi barcha genlarga taalluqli universal molekulyar soat bo'lishi mumkin deb o'ylangan ( Ochman va Wilson, 1987 ). Endi biz molekulyar soatlar turli organizmlarda har xil ekanligini va hatto bitta organizm ichida ham o'zgaruvchanligini tushunamiz ( Strauss, 1999 ). Organizmlar o'rtasidagi tafovutlar nasl vaqtlari natijasi bo'lishi mumkin, chunki nasl berish vaqti qisqa bo'lgan turlar DNK replikatsiyasi xatolarini uzoqroq vaqtga ega turlarga qaraganda tezroq to'plashi mumkin. Bu, ehtimol, kemiruvchilar primatlarga qaraganda tezroq molekulyar soatga ega bo'lgan kuzatuvni tushuntiradi ( Gu va Li, 1992 ). Organizm ichidagi o'zgarishlar quyidagicha:

• 
  Sinonimik bo'lmagan almashtirishlar sinonimlarga qaraganda sekinroq sodir bo'ladi. Buning sababi shundaki, oqsilning aminokislotalar ketma-ketligi o'zgarishiga olib keladigan mutatsiya organizm uchun zararli bo'lishi mumkin, shuning uchun populyatsiyada sinonim bo'lmagan mutatsiyalarning to'planishi tabiiy tanlanish jarayonlari bilan kamayadi ( 16.3 -bandga qarang ). Bu shuni anglatadiki, ikkita turdagi genlar ketma-ketligi taqqoslanganda, odatda sinonimik almashtirishlarga qaraganda kamroq sinonim bo'lmaganlar mavjud.
  
• 
  Mitoxondriyal genlarning molekulyar soati yadro genomidagi genlarga qaraganda tezroq. Buning sababi, ehtimol, mitoxondriyalarda yadro genlarida ishlaydigan ko'plab DNK ta'mirlash tizimlari mavjud emas ( 14.2-bo'lim ; Gibbons, 1998 ).
  

Ushbu murakkabliklarga qaramay, molekulyar soatlar daraxtlarni qayta qurish uchun juda qimmatli yordamchi vositaga aylandi, chunki biz keyingi bo'limda molekulyar filogenetikning odatiy loyihalarini ko'rib chiqamiz.
16.3. Molekulyar filogenetikaning qo'llanilishi
Molekulyar filogenetika 1990-yillarning boshidan buyon o'sdi, bu asosan daraxt qurishning yanada qat'iy usullarini ishlab chiqish, dastlab PCR tahlili va yaqinda genom loyihalari orqali olingan DNK ketma-ketligi haqidagi ma'lumotlarning portlashi bilan birgalikda o'sdi. Molekulyar filogenetikaning ahamiyati, shuningdek, biologiyadagi ba'zi murakkab masalalarga daraxtlarni qayta tiklash va boshqa filogenetik usullarni muvaffaqiyatli qo'llash orqali ham oshdi. Ushbu yakuniy bo'limda biz ushbu muvaffaqiyatlarning ba'zilarini ko'rib chiqamiz.