Mundarija: Kirish I. Bob. Zamonaviy bioinformatsion ma'lumotlar asoslari


Download 0.73 Mb.
bet4/13
Sana15.11.2023
Hajmi0.73 Mb.
#1776103
1   2   3   4   5   6   7   8   9   ...   13
Bog'liq
Mundarija Kirish I. Bob. Zamonaviy bioinformatsion ma\'lumotlar

Albatta, keyinchalik bu ma'lumotlar ma'lumotlar bazasi ma'muriyati xodimlari tomonidan tekshiriladi va sezilarli darajada to'ldiriladi. Barcha asoslarda ikkinchi asosiy axborot manbai maxsus ilmiy adabiyotlardir. Bir hil ma'lumot to'plash ustida ishlaydigan ko'plab ma'lumotlar bazalari xalqaro mehnat taqsimotini amalga oshirgan holda o'z sa'y-harakatlarini muvofiqlashtiradi, buni EMBL (Yevropa), GenBank (AQSh), DDBJ (Yaponiya) nukleotidlar ketma-ketligining uchta jahon to'plami o'rtasidagi hamkorlik misolida ko'rsatish mumkin.

Albatta, keyinchalik bu ma'lumotlar ma'lumotlar bazasi ma'muriyati xodimlari tomonidan tekshiriladi va sezilarli darajada to'ldiriladi. Barcha asoslarda ikkinchi asosiy axborot manbai maxsus ilmiy adabiyotlardir. Bir hil ma'lumot to'plash ustida ishlaydigan ko'plab ma'lumotlar bazalari xalqaro mehnat taqsimotini amalga oshirgan holda o'z sa'y-harakatlarini muvofiqlashtiradi, buni EMBL (Yevropa), GenBank (AQSh), DDBJ (Yaponiya) nukleotidlar ketma-ketligining uchta jahon to'plami o'rtasidagi hamkorlik misolida ko'rsatish mumkin.

Keling, ma'lumotlar bazalari nima ekanligini, ularda nima joylashtirilganiga qarab aniqlaylik. Birinchi tur - arxiv ma'lumotlar bazalari, bu katta ma’lumotxona bo'lib, u yerda har kim xohlagan narsasini qo'yishi mumkin. Bu asoslar o'z ichiga oladi


  • GeneBank & EMBL - asosiy ketma-ketliklar shu yerda saqlanadi

  • PDB - oqsillarning fazoviy tuzilmalari va boshqalar.

Ikkinchi tur - bu ma'lumotlar bazasi egalari ishonchliligi uchun javobgar bo'lgan ma'lumotlar bazalari. U yerga hech kim ma'lumot yubormaydi, u mutaxassislar tomonidan arxiv ma'lumotlar bazalaridan tanlab olinadi, ma'lumotlarning to'g'riligini tekshiradi - bu ketma-ketliklarda nima qayd etilgan, bu ketma-ketliklar muayyan funktsiyani bajarishiga ishonish uchun qanday eksperimental asoslar mavjud

Ushbu turdagi ma'lumotlar bazalariga quyidagilar kiradi:


  • Swiss-Prot - protein aminokislotalar ketma-ketligini o'z ichiga olgan eng yuqori sifatli ma'lumotlar bazasi

  • KEGG - metabolizm haqida ma'lumot

  • FlyBase - Drosophila haqida ma'lumot

  • COG - onkologik genlar haqida ma'lumot.

Download 0.73 Mb.

Do'stlaringiz bilan baham:
1   2   3   4   5   6   7   8   9   ...   13




Ma'lumotlar bazasi mualliflik huquqi bilan himoyalangan ©fayllar.org 2024
ma'muriyatiga murojaat qiling