Oqsillarni identifikatsiyalash resursi (Protein Identification Resource,pir) Reja Kirish Asosiy qism. I-bob Oqsillarni identifikatsiyalash resursi

1.4.Proteinlar va genomik ketma-ketliklar atlasi CD-ROM
Proteinlar va genomik ketma-ketliklar atlasi CD-ROMida ATLAS ma'lumot qidirish tizimi, o'xshashliklarni qidirish uchun FASTA dasturi ( 24 ), PIR-xalqaro oqsil ketma-ketligi ma'lumotlar bazasi, NRL_3D ma'lumotlar bazasi, PIR-ALN oqsillarni moslashtirish ma'lumotlar bazasi, RESID ma'lumotlar bazasi mavjud. Qoldiq modifikatsiyalari, PATCHX ma'lumotlar bazasi va Escherichia coli K12 genomik ma'lumotlar bazasi ( 7 ).ATLAS dasturi bir vaqtning o'zida bir nechta ma'lumotlar bazalariga kirish imkonini beruvchi to'liq integratsiyalangan ko'p ma'lumotlar bazasiga kirish dasturidir. Asosan makromolekulyar ketma-ketlik ma'lumotlar bazalarini boshqarish uchun mo'ljallangan bo'lsa-da, u matnli ma'lumotlar bazalarida ishlashi mumkin. Dastur ko'p ma'lumotlar bazasi, ko'p sohali indeks tuzilmasidan foydalanadi. Ushbu dizayn tanlangan ma'lumotlar bazalari to'plamidan va ushbu ma'lumotlar bazalari ichidagi maydonlarning har qanday kombinatsiyasidan bir vaqtning o'zida olish imkonini beruvchi ramkani taqdim etadi. ATLAS biologik izohlar va bibliografik ma'lumotlar, masalan, oqsil nomlari, superfamila nomlari, homologiya domenlari, organizm nomlari, gen nomlari, kalit so'zlar, xususiyat tavsiflari, mualliflar kabi biologik ma'lumotlarga bir vaqtning o'zida qidirish uchun tanlangan ma'lumotlar bazalaridagi yozuvlarni dinamik ravishda bog'lashi mumkin bo'lgan foydalanuvchilarga qulay muhitni taqdim etadi. ismlar va boshqalar.“Oqsil va genomik ketma-ketliklar atlasi foydalanuvchi qoʻllanmasi” har bir nashr bilan yangilanadi va CD-ROMga PostScript va oddiy matn versiyalarida qoʻshiladi; bosma shaklda ham alohida olinishi mumkin.
Murakkab karbongidrat tuzilmasi ma'lumotlar bazasi (CCSD) ( 25 ) va unga tegishli CarbBank dasturi Atlas CD-ROMida mavjud. CarbBank vakili Skott Dubet PIR-International kompaniyasiga CCSD, dasturiy ta'minot va hujjatlarni tarqatish uchun taqdim etadi. CarbBank CCSD ma'lumotlar bazasi fayllari uchun kompyuter boshqaruv tizimi bo'lib, menyuga asoslangan foydalanuvchi interfeysiga ega va hozirda kompyuter yoki MS-DOS IBM-mos keluvchi mikrokompyuterlarda ishlaydi. Tez orada Windows™ versiyasi chiqishi kutilmoqda. CarbBank uchun o'rnatish bo'yicha qo'llanma va qo'llanmani CD-ROMdan chop etish mumkin. CD-ROM ISO 9660 standartiga muvofiq formatlangan va ushbu standartni qo'llab-quvvatlaydigan har qanday kompyuter tizimidan o'qilishi mumkin. ATLAS dasturi hozirda PC-DOS, VAX/VMS, OpenVMS Alpha AXP, DEC UNIX Alpha AXP, DEC ULTRIX (RISC), SunOS, SGI/IRIX va Macintosh tizimlarida ishlaydi. Dastur C kompyuter tilida yozilgan va ANSI standartiga mos keladi.Tegishli ma'lumotlarga ega PIR-Xalqaro oqsillar ketma-ketligi ma'lumotlar bazasi turli magnit tashuvchilarda ham mavjud.PIR-Xalqaro ma'lumotlar bazalari va dasturiy ta'minotini qanday olish mumkinMavjud ma'lumotlar bazasi relizlari yoki boshqa xizmatlar haqida ma'lumot olish uchun PIR Texnik Xizmatlar Koordinatori, Milliy Biotibbiyot Tadqiqotlar Jamg'armasi, 3900 Reservoir Road, NW, Vashington, DC 20007, AQSh bilan bog'laning. Tel: [phone]; Faks: [phone]; elektron pochta: [e-mail] . Evropada MIPS bilan bog'laning: Martinsried oqsil ketma-ketligi instituti, Maks Plank biokimyo instituti, D-82152 Martinsried, Germaniya. Tel: [phone]; Faks: [phone]; elektron pochta: [e-mail] . Osiyo yoki Avstraliyada JIPID bilan bog'laning: Yaponiya xalqaro protein ma'lumotlar bazasi, Tokio ilmiy universiteti, 2669 Yamazaki, Noda 278, Yaponiya. Tel: [phone]; Faks: [phone]; elektron pochta: [e-mail].