O’zbekiston respublikasi oliy va o’rta maxsus ta’lim vazirligi denov tadbirkorlik va pedagogika instituti biologiya fakulteti 3-bosqich talabasi Abdullayeva Dilshodaning Genetika va Genomika asoslari fanidan. Mustaqil ishi. Mavzu

Yuqori mahsuldorlik ketma-ketligi. Shuningdek qarang: Illumina bo'yoqlarini ketma-ketligi va Ion yarim Supero'tkazuvchilar ketma-ketligi.
Arzon narxlardagi ketma-ketlikka bo'lgan yuqori talab yuqori samaradorlikdagi ketma-ketlik texnologiyalarini ishlab chiqishga sabab bo'ldi parallellashtirmoq ketma-ketlik jarayoni, bir vaqtning o'zida minglab yoki millionlab ketma-ketliklarni ishlab chiqarish. Yuqori o'tkazuvchanlik ketma-ketligi DNK sekvensiyasining narxini standart bo'yoq terminatori usullari bilan mumkin bo'lgan darajadan pastga tushirish uchun mo'ljallangan. Ultra yuqori o'tkazuvchanlikdagi ketma-ketlikda 500 000 gacha sintez bo'yicha sintez bo'yicha operatsiyalar parallel ravishda bajarilishi mumkin.
Illumina Genom analizatori II tizimi. Illumina texnologiyalari yuqori o'tkazuvchanlik massivida parallel ketma-ketlik standartini o'rnatdi.
 Illumina bo'yoqlarini ketma-ketligi usul qaytariladigan bo'yoq terminatorlariga asoslangan va 1996 yilda Jeneva biomedikal tadqiqot institutida Paskal Mayer va Loran Farinelli tomonidan ishlab chiqilgan. Ushbu usulda DNK molekulalari va primerlari dastlab slaydga biriktiriladi va kuchaytiriladi polimeraza shunday qilib dastlab klonlangan "DNK koloniyalari" bo'lgan mahalliy klonal koloniyalar hosil bo'ladi. Ketma-ketlikni aniqlash uchun to'rt turdagi qaytariladigan terminator asoslari (RT-bazalar) qo'shiladi va qo'shilmagan nukleotidlar yuviladi. Pirosekvensiyadan farqli o'laroq, DNK zanjirlari bir vaqtning o'zida bitta nukleotidga cho'zilib ketadi va tasvirni olish kechiktirilgan vaqtda amalga oshirilishi mumkin, bu DNK koloniyalarining juda katta massivlarini bitta kameradan olingan ketma-ket tasvirlar orqali olish imkonini beradi. Fermentatik reaktsiyani ajratish va tasvirni olish optimal ishlash qobiliyatini va nazariy jihatdan cheksiz sekanslash imkoniyatini beradi; tegmaslik konfiguratsiyaga ega bo'lgan holda, asbobning ishlash samaradorligi faqat bog'liq A / D konversiyasi kameraning tezligi. Kamera tasvirlarni oladi lyuminestsent yorliqli nukleotidlar, so'ngra bo'yoq 3 'bloker bilan birga DNKdan kimyoviy yo'l bilan tozalanadi va keyingi tsiklga imkon beradi.
Muqobil yondashuv, ion yarimo'tkazgichlar ketma-ketligi, standart DNK replikatsiya kimyosiga asoslangan. Ushbu texnologiya har safar bazaga qo'shilganda vodorod ionining chiqishini o'lchaydi. Shablon DNKni o'z ichiga olgan mikroto'lqin bitta singdirilgan nukleotid, agar nukleotid shablon zanjiriga qo'shimcha bo'lsa, u qo'shiladi va vodorod ioni ajralib chiqadi. Ushbu versiya an ISFET ion sensori. Agar a gomopolimer shablon ketma-ketligida mavjud bo'lib, bir nechta nukleotidlar bitta toshqin tsikliga kiritiladi va aniqlangan elektr signali mutanosib ravishda yuqori bo'ladi.
Ketma-ket yig'ish. Bir-birining ustiga chiqib ketish shakl shakllarini o'qiydi; ma'lum uzunlikdagi tutashuv va bo'shliqlar iskala hosil qiladi.
Birlashtirilgan so'nggi ma'lumot genomga mos keltirilgan keyingi avlod ketma-ketligini ma'lumotlarni o'qiydi.
Bir nechta, qismlarga bo'lingan ketma-ketlik ko'rsatkichlari bir-birining ustiga tushgan joylari asosida yig'ilishi kerak.
Ketma-ket yig'ish ga tegishli tekislash va ancha uzunroq bo'laklarni birlashtirish DNK dastlabki ketma-ketlikni tiklash uchun ketma-ketlik. Bu hozirgi kabi kerak DNKning ketma-ketligi texnologiya butun genomlarni doimiy ketma-ketlik sifatida o'qiy olmaydi, aksincha ishlatilgan texnologiyaga qarab 20 dan 1000 tagacha bo'lgan kichik qismlarni o'qiydi. PacBio yoki Oksford Nanopore kabi uchinchi avlod sekvensiya texnologiyalari muntazam ravishda> 10 kb uzunlikdagi ketma-ketlikni o'qiydi; ammo, ular yuqori xato darajasi taxminan 15 foizni tashkil etadi. Odatda o'qishlar deb nomlangan qisqa qismlar natijadan kelib chiqadi ov miltig'ini ketma-ketligi genomik DNK yoki genlarning transkriptlari (ESTlar).