O’zbekiston respublikasi oliy va o’rta maxsus ta’lim vazirligi denov tadbirkorlik va pedagogika instituti biologiya fakulteti 3-bosqich talabasi Abdullayeva Dilshodaning Genetika va Genomika asoslari fanidan. Mustaqil ishi. Mavzu

Strukturaviy genomika
Strukturaviy genomika tasvirlashga intiladi 3 o'lchovli tuzilish berilgan tomonidan kodlangan har bir oqsildan genom. Ushbu genomga asoslangan yondoshuv kombinatsiyalashgan holda strukturani aniqlashning yuqori o'tkazuvchanlik usuliga imkon beradi eksperimental va modellashtirish yondashuvlari. Strukturaviy genomika bilan asosiy farq an'anaviy tarkibiy bashorat shundan iboratki, strukturaviy genomika ma'lum bir oqsilga e'tibor qaratish o'rniga, genom tomonidan kodlangan har bir oqsilning tuzilishini aniqlashga harakat qiladi. To'liq genomlar ketma-ketligi mavjud bo'lganda, strukturani bashorat qilish eksperimental va modellashtirish yondashuvlari yordamida tezroq amalga oshirilishi mumkin, ayniqsa, ko'p sonli ketma-ket genomlar va ilgari hal qilingan oqsil tuzilmalari mavjudligi olimlarga oqsil tuzilishini ilgari echilgan tuzilmalar bo'yicha modellashtirishga imkon beradi. gomologlar. Strukturaviy genomika strukturani aniqlashga ko'plab yondashuvlarni, shu jumladan genomik ketma-ketliklardan foydalanadigan eksperimental usullarni yoki ketma-ketlikka asoslangan modellashtirishga asoslangan yondashuvlarni o'z ichiga oladi. tarkibiy homologiya ma'lum tuzilishdagi oqsilga yoki biron bir ma'lum tuzilishga homologiyasi bo'lmagan oqsil uchun kimyoviy va fizikaviy printsiplarga asoslanadi. An'anaviy farqli o'laroq tarkibiy biologiya, a ni aniqlash oqsil tuzilishi tizimli genomika harakati orqali ko'pincha (lekin har doim ham) oqsil funktsiyasi haqida hamma narsa ma'lum bo'lishidan oldin keladi. Bu yangi muammolarni keltirib chiqaradi tarkibiy bioinformatika, ya'ni undan protein funktsiyasini aniqlash 3D tuzilishi.
Epigenomika. Epigenomika ning to'liq to'plamini o'rganishdir epigenetik deb nomlanuvchi hujayraning genetik materialidagi modifikatsiyalar epigenom. Epigenetik modifikatsiyalar - bu DNK ketma-ketligini o'zgartirmasdan gen ekspressioniga ta'sir ko'rsatadigan hujayraning DNKsi yoki gistonlaridagi qaytariladigan modifikatsiyalar (Russell 2010 p. 475). Eng xarakterli epigenetik modifikatsiyalardan ikkitasi DNK metilatsiyasi va giston modifikatsiyasi. Epigenetik modifikatsiyalar genlarning ekspressioni va regulyatsiyasida muhim rol o'ynaydi va kabi ko'plab uyali jarayonlarda ishtirok etadi farqlash / rivojlanish va shish paydo bo'lishi. Epigenetikani global darajada o'rganish yaqinda genomik yuqori o'tkazuvchanlik tahlillarini moslashtirish orqali amalga oshirildi.
Metagenomika. Atrof-muhitdagi o'qotar qurollarni ketma-ketligi (ESS) metagenomikaning asosiy usuli hisoblanadi. A) yashash joyidan namuna olish; (B) filtrlovchi zarralar, odatda kattaligi bo'yicha; C) lizis va DNK ekstraktsiyasi; D) klonlashtirish va kutubxona qurilishi; E) klonlarni ketma-ketligi; (F) ketma-ketlik va iskala ichiga yig'ish.
Metagenomika o'rganishdir metagenomlar, genetik to'g'ridan-to'g'ri tiklangan material atrof-muhit namunalar. Keng sohani atrof-muhit genomikasi, ekogenomika yoki jamoat genomikasi deb ham atash mumkin. An'anaviy bo'lsa ham mikrobiologiya va mikrobial genomlar ketma-ketligi yetishtiriladigan narsalarga tayanish klonal madaniyatlar, erta atrof-muhit genlarini sekvensiyalash klonlangan o'ziga xos genlarni (ko'pincha 16S rRNK gen) hosil qilish xilma-xillik profili tabiiy namunada. Bunday ishlar shuni ko'rsatdiki, aksariyat qismi mikroblarning biologik xilma-xilligi tomonidan o'tkazib yuborilgan edi etishtirishga asoslangan usullari. So'nggi tadqiqotlarda "ov miltig'i" ishlatilgan Sanger ketma-ketligi yoki katta darajada parallel pirosekvensiya namuna olingan jamoalarning barcha a'zolaridan asosan barcha genlarning xolis namunalarini olish. Mikroskopik hayotning ilgari yashiringan xilma-xilligini ochib berishga qodir bo'lganligi sababli, metagenomika butun tirik dunyoni tushunishda inqilob qilish qobiliyatiga ega bo'lgan mikrob dunyosini ko'rish uchun kuchli linzalarni taqdim etadi.