O’zbekiston respublikasi oliy va o’rta maxsus ta’lim vazirligi denov tadbirkorlik va pedagogika instituti biologiya fakulteti 3-bosqich talabasi Abdullayeva Dilshodaning Genetika va Genomika asoslari fanidan. Mustaqil ishi. Mavzu

Miltiqni ketma-ketligi. ABI PRISM 3100 genetik analizatori. Bunday kapillyar sekvensiyalar dastlabki yirik genomli sekvensiya ishlarini avtomatlashtirgan.
Miltiqni ketma-ketligi. Miltiq otish sekvensiyasi - bu butun xromosomalarga qadar 1000 taglik juftlikdan uzunroq bo'lgan DNK sekanslarini tahlil qilish uchun mo'ljallangan sekvensiya usuli. U "a" ning tez sur'atlar bilan kengayib borayotgan, kvaziyu tasodifiy otish sxemasiga o'xshashligi bilan nomlangan ov miltig'i. Jel elektroforez ketma-ketligi faqat juda qisqa ketma-ketliklar uchun ishlatilishi mumkin bo'lganligi sababli (100 dan 1000 tagacha juftlik), uzunroq DNK sekanslari tasodifiy kichik bo'laklarga bo'linib, keyinchalik ularni olish uchun ketma-ketlashtirilishi kerak. o'qiydi. Maqsadli DNK uchun bir nechta takrorlanadigan o'qishlar ushbu parchalanish va ketma-ketlikning bir necha turlarini bajarish orqali olinadi. Keyinchalik, kompyuter dasturlari ularni doimiy ketma-ketlikda yig'ish uchun har xil o'qishlarning bir-birining ustki qismidan foydalanadi. Ov miltig'ining ketma-ketligi - bu tasodifiy namuna olish jarayoni, bu berilganlikni ta'minlash uchun ortiqcha namuna olishni talab qiladi nukleotid qayta tiklangan ketma-ketlikda ifodalanadi; genom ortiqcha namuna oladigan o'rtacha o'qishlar soni deyiladi qamrov.
O'z tarixining ko'p qismida ov miltig'ini ketma-ketlikda yotqizish texnologiyasi klassik zanjirni to'xtatish usuli yokiSanger usuli', bu zanjirni tugatishni tanlab qo'shilishiga asoslanadi dideoksinukleotidlar tomonidan DNK polimeraza davomida in vitro DNKning replikatsiyasi. So'nggi paytlarda ov miltig'ini ketma-ketligi o'rnini bosdi yuqori o'tkazuvchanlik ketma-ketligi usullar, ayniqsa keng ko'lamli, avtomatlashtirilgan genom tahlil qiladi. Biroq, Sanger usuli, birinchi navbatda, kichik hajmdagi loyihalar uchun va ayniqsa uzoq davom etgan DNK ketma-ketligini o'qish uchun (> 500 nukleotid) keng qo'llaniladi. Zanjirni to'xtatish usullari uchun DNKning bir zanjirli shablonini, DNKni talab qiladi astar, DNK polimeraza, normal dezoksinukleosidetrifosfatlar (dNTPlar) va DNK zanjirining cho'zilishini tugatadigan modifikatsiyalangan nukleotidlar (dideoksiNTPlar). Ushbu zanjir bilan tugaydigan nukleotidlarda 3'- yo'q OH shakllanishi uchun zarur bo'lgan guruh fosfodiester aloqasi ddNTP qo'shilganda DNK polimeraza DNKning kengayishini to'xtatishiga olib keladigan ikkita nukleotid o'rtasida bo'ladi. DdNTP radioaktiv yoki bo'lishi mumkin lyuminestsent tarzda ichida aniqlash uchun belgilangan DNK sekvensiyalari. Odatda, ushbu mashinalar kuniga 48 tagacha bitta to'plamda 96 ta DNK namunalarini ketma-ket ketma-ketlikda to'plashi mumkin.