Qabul qilingan maqola Mualliflar: Yang Yu va Martina Delbianko Iqtibos sifatida

2.2. Histo-qon guruhi antijenlari
Shakl 6. Deoksiftorinatsiya glikan NMRning kimyoviy siljish degeneratsiyasini buzadi
va epitopni xaritalash imkonini beradi. Ref [35b] ruxsati bilan moslashtirilgan
Shakl 7. Histo-qon guruhi antijenlarining tasnifi. Monosaxaridlar glikanlarning (SNFG)
ramz nomenklaturasiga muvofiq ifodalanadi.[27]
Shakl 5. Tetra-antenna N ning PCS va minimal energiya konformatsiyalari
NMR o'lchovi va MD simulyatsiyasi orqali olingan glikan. Ref [34] ruxsati bilan
moslashtirilgan
.
.
MINIRIZA
Qabul
qilingan
qoÿlyozma
Machine Translated by Google

---

Qabul
qilingan
qoÿlyozma
MINIRIZA
Termodinamik va kinetik parametrlar shuni ko'rsatadiki, fukoza qoldig'i
bog'lanishga bilvosita hissa qo'shadi, konformatsion moslashuvchanlikni
kamaytiradi va shuning uchun bog'lanishning entropik jazosini
kamaytiradi.
Lyuis antijenlari orasida sialil Lyuis X (sLex ) selektinlar bilan o'zaro
aloqada bo'lgan hujayra-hujayra aloqasidagi muhim roli tufayli eng
intensiv o'rganilgan tuzilma hisoblanadi. Asosiy tuzilma, Lyuis X
(LeX ), NMR[40] va molekulyar dinamika[40] tomonidan aniqlangan
eritmada aniqlangan konformatsiyani qabul qiladigan trisaxarid
motiviga ega . Bunday konformatsiya ekzo-anomerik effekt, sterik
siqilish va hidrofobik o'zaro ta'sirlar bilan barqarorlashadi . 1996 yilda
LeX ning birinchi kristall tuzilishi haqida xabar berildi, bu uning
konformatsiyasini barqarorlashtiradigan vodorod bog'larining zich
tarmog'ini ko'rsatadi.[41] Eritma fazasi konformatsiyasini yaxshiroq
tushunish uchun LeX trisaxaridlari sintez qilindi va izotopik etiketli
bakterial oqsil bilan kovalent bog'landi.[42]
Xuddi shunday, katta entropiya hissasi sLeX va E-selektin o'rtasidagi
bog'lanishni boshqaradi . Odatda, glikanlar va lektinlar o'rtasidagi
o'zaro ta'sir entropik jihatdan noqulay, lekin qulay bog'lanish entalpiyasi
bilan boshqariladi.[46] Biroq, sLeX -E-selektin o'zaro ta'sirida , sLeX
ning oldindan tashkil etilishi bog'lanish joyida mavjud bo'lgan suv
klasteri uchun surrogat bo'lib xizmat qiladi.[47] Bog'langandan so'ng,
suv bog'lanish joyidan chiqariladi, bu esa umumiy jarayon uchun
entropik foyda keltiradi. Bundan tashqari, sLeX ning oldindan tashkil
etilishi bog'lanishning o'ziga xosligini oshiradigan bir qator yo'naltirilgan
H-bog'larni taklif qiladi.
Ushbu gipotezani tizimli ravishda isbotlash uchun A- va B- qon guruhi
tetrasaxaridlari (II turdagi), shuningdek, ularning fukozillanmagan
analoglari sintez qilindi (9-rasm). [45] STD-NMR , b-Gal qoldig'i (9-
rasm, chiziqli qutilar) galektin-3 bilan bog'lanishda bevosita ishtirok
etishini taklif qildi , fukoza qoldig'i esa lektin bilan o'zaro ta'sir qilmaydi.
Bu shuni ko'rsatdiki, Fuc o'z ichiga olgan glikanlar lektinga yuqori
darajada yaqinlik qilsa ham, fukozilatlanmagan analoglar bilan bir xil
bog'lanish rejimiga ega.
galaktoza qoldig'i va lektinning Trp qoldig'i. LeX ning bunday
moslashuvchan konformatsiyasi yuqori yaqinlikdagi glikomimetikalarni
loyihalash uchun kimyoviy jihatdan sozlanishi mumkin. Masalan,
terminal galaktozani mannoz birligi bilan almashtirish LeX ning
konformatsion qattiqligini buzishi va bog'lanish uchun zarur bo'lgan
"ochiq" konformatsiyani barqarorlashtirishi ko'rsatilgan (10-rasm).
[13b] Ushbu g'ayritabiiy analogning sterik to'siqlarining kamayishi
lektinga mahalliy analogga qaraganda 17 baravar yuqori yaqinlikka olib keldi.
Bunday hollarda, fukosilatsiya HBGA ning lektinlarga yuqori darajada
bog'lanishi uchun javobgar bo'lib, konformatsion tanlash bosqichini
bartaraf etadigan "oldindan tashkiliy" ni targ'ib qiladi.
Ushbu deformatsiya o'rtasidagi sterik to'siqni chiqaradi
Suvdagi glikan va uning lektin bilan o'zaro ta'sirining juda batafsil MD
simulyatsiyalaridan foydalangan holda fukoza qoldig'i lektin bilan H
aloqalarini hosil qiladigan bir nechta "ochiq" konformerlar aniqlandi.
Ko'pgina lektinlar bilan bog'langanda, kristallografik va NMR tahlillari
bilan tasdiqlangan LeXning "yopiq" konformatsiyasi saqlanib qoladi.[44]
Ushbu strategiya oligosakkaridlarning tushishini sekinlashtirishga
imkon berdi va shuning uchun NOElarni aniqlashga yordam berdi.
To'qqizta qoldiqlararo NOE aniqlandi, faqat uchtasini bepul LeX uchun
ko'rish mumkin edi . LeX va oqsil o'rtasida hech qanday NOE
aniqlanmadi , bu natijalar erkin LeX ning konformatsiyasining vakili
ekanligini tasdiqlaydi . Ushbu tadqiqot glikozid aloqalarining burilish
burchaklari va LeX'in umumiy shakli haqida muhim tizimli ma'lumotlarni
taqdim etdi . Xususan, fukoza va galaktoza qoldig'i o'rtasidagi
noan'anaviy CH · · · OH bog'lanishi aniqlangan va fukoza qoldig'ining
H5 ning pastga kimyoviy siljishi bilan tasdiqlangan (8a-rasm). Bunday
o'zaro ta'sir LeX trisaxarid motivining "yopiq" konformatsiyasini
barqarorlashtiradi . Ushbu noan'anaviy CH···O H-bog'lanishining
mavjudligi keyinchalik sLex-da keng ko'lamli NMR tadqiqoti bilan
tasdiqlangan. [43] Fukoza oÿz ichiga olgan bir nechta
oligosakkaridlarning tizimli tahlili shuni koÿrsatdiki, bu maxsus CH···O
H-bogÿlanishi bakterial va sutemizuvchilar oligosakkaridlarining keng
diapazonida keng tarqalgan ikkilamchi struktura elementi boÿlib, uni X
ÿ b1,4 ÿ bilan umumlashtirish mumkin . [Fuca1,3]-Y va X-b1,3-[Fuca1,4]-
Y tavsifi (8b-rasm). [16a]
Bundan farqli o'laroq, Ralstonia solanacearum lektin bilan
bog'langanda , LeX "yopiq" konformatsiyasining buzilishi kuzatildi.[48]
Kimyo - Yevropa jurnali
6
Ushbu maqola mualliflik huquqi bilan himoyalangan. Barcha huquqlar himoyalangan.
10.1002/chem.202001370