Qabul qilingan maqola Mualliflar: Yang Yu va Martina Delbianko Iqtibos sifatida

ADAADA-OH
AEAAEA-OH
ACACAC-OH
AFAAFA-OH
1
MINIRIZA
Qabul
qilingan
qoÿlyozma
MD simulyatsiyalari orqali.
Shakl 14. O'ziga xos modifikatsiyaga ega bo'lgan maxsus tayyorlangan
tsellyuloza oligosakkaridlari va olingan oligosakkaridlarning vakili
Shakl 13. MD simulyatsiyasi orqali olingan zwitterionik Streptococcus
pneumoniae serotipli geksasakkarid, noasaxarid va dodekasaxaridning vakili
konformatsiyasi . Ref[13a] ruxsati bilan qayta
nashr etilgan
Machine Translated by Google

---

n
m
Qabul
qilingan
qoÿlyozma
b6 NH2
b6 NH2
Glc
b6
b6
Kishi
b6
b6
13C6-Glc
n
Ko'pgina GAGlar chap qo'l spirallarini ko'rsatish uchun hisoblangan,
xondroitin va dermatan sulfatdan tashqari, o'ng qo'l spiral tuzilishini
ko'rsatadi. Kondroitin va gialuronan fragmentlari ularning konformatsiyasi
uchun mas'ul bo'lgan yuqori dinamik intramolekulyar H-bog'larini
aniqlash uchun model sifatida ishlatilgan.
[72]
MD modelini tasdiqlovchi J muftalarini o'lchash imkonini beruvchi 13C6
etiketli glyukoza birligi geksasakkarid zanjirining o'ziga xos holatiga
o'rnatildi .
Keyinchalik yondashuv aminokislotalar va/yoki karboksilik kislotalarni
o'z ichiga olgan ionli tsellyuloza analoglariga kengaytirildi.[68]
Strukturaviy tahlil zaryad naqshining glikan konformatsiyasiga qanday
ta'sir qilishini ochib beradi.
Sulfatsiya naqshlari GAGlarning konformatsiyasi va dinamikasida ham
muhim rol o'ynaydi. Turli xil sulfatlanish naqshlari (sHA) bo'lgan gialuron
kislotalarining bo'laklari sintez qilingan va sirt bilan kovalent bog'langan.
[76] Elektrokimyoviy impedans spektroskopiyasi (EIS) GAG va metall
o'rtasidagi o'zaro ta'sirni taklif qildi.
GAG oligomerlari bo'yicha ko'pgina strukturaviy tadqiqotlar mahalliy
konformatsion o'zgarishlarga qaratilgan. Aksariyat monosaxaridlar
qat'iy o'rindiq konformatsiyasini (ya'ni 4C1 va 1C4) saqlasada, geparin
va geparin sulfatda joylashgan L-iduron kislotasi bir nechta
konformatsiyalarni qabul qiladi. Sintetik pentasaxaridning NMR tahlili L-
iduron kislotasining asosiy konformeri sifatida g'ayrioddiy 2S0 qayiq
konformerini aniqladi.[73] Ushbu g'ayritabiiy konformatsiyaning biologik
ma'nosini tushunish uchun 4C1, 1C4 yoki 2S0 konformatsiyasiga
qulflangan L-iduron qoldig'i bilan uchta pentasaxarid sintez qilindi (17-
rasm). [74] Faqat 2S0 - qulflangan pentasaxarid antitrombin bilan kuchli
bog'lanadi va qon ivish proteaza omilini inhibe qilishni kuchaytiradi. Bu
2S0 egilgan qayiq geometriyasi qon ivishini nazorat qilish uchun zarur
ekanligini aniq ko'rsatadi . 2S0 konformerining ahamiyati NMR
tajribalari, kristallografiya va hisoblash usullari yordamida qo'shimcha
tekshirildi, natijada rentgen nurlari diffraktsiyasi orqali 2S0 konformerining
vizualizatsiyasi paydo bo'ldi .[75]
Glikozaminoglikanlar (GAG) sutemizuvchilarda muhim biologik rolga
ega bo'lgan muhim tarkibiy materiallar sinfidir.[69] GAGlar manfiy
zaryadlangan polisaxaridlar bo'lib, disaxaridlarni takrorlovchi birliklardan
tashkil topgan. Gialuronat (HA), xondroitin sulfat (CS), dermatan sulfat
(DS), keratan sulfat (KS), geparan sulfat (HS) va geparin eng keng
tarqalgan GAGlardir. Ularning strukturaviy xilma-xilligi va konformatsion
moslashuvchanligi ularning strukturaviy tahliliga xalaqit beradi. Aniq
belgilangan tuzilmalarga kirish uchun kimyoviy strategiyalar hali ham
juda mehnat talab qiladi[70] va tegishli sintetik GAGlarning katta
to'plamlari hali mavjud emas. Bundan tashqari, ularning zich
taqsimlangan zaryadlari ularning suv va metall ionlari bilan o'zaro
ta'siriga keskin ta'sir qiladi, ko'pincha jellar hosil bo'ladi. [71]
Tabiiy va g'ayritabiiy tuzilmalarga o'xshash oligo- va polisaxaridlarning
turli sinflari AGA bilan sintez qilingan. [10b] MD simulyatsiyalari va NMR
tahlillari shuni ko'rsatadiki, har bir oligomer boshqa geometriya va
moslashuvchanlikni taqdim etadi. Masalan, a-1,6-oligomannozid suvda
egiluvchan chiziqli tuzilmani qabul qiladi, b-1,6-oligoglyukozidning
analogi esa yanada ixcham spiral strukturani ko'rsatadi (16-rasm).
Sintetik yondashuv NMR tahlilini ta'minlab, 13C etiketli analoglarni
sintez qilishga imkon berdi.
4