Qabul qilingan maqola Mualliflar: Yang Yu va Martina Delbianko Iqtibos sifatida
Download 1.6 Mb. Pdf ko'rish
|
ilmira (2)
- Bu sahifa navigatsiya:
- VoR ga havola
- MINIRIZA Oligosakkaridlarning konformatsion tadqiqotlari
|
Qabul qilingan maqola Mualliflar: Yang Yu va Martina Delbianko Iqtibos sifatida: Chem. Yevro. J. 10.1002/chem.202001370 Sarlavha: Oligosakkaridlarning konformatsion tadqiqotlari Ushbu qo'lyozma ko'rib chiqishdan so'ng qabul qilingan va Yozuvning oxirgi Versiyasini (VoR) tahrir qilish, tekshirish va rasmiy nashr qilishdan oldin onlaynda Qabul qilingan maqola sifatida paydo bo'ladi. Bu ish hozirda quyida keltirilgan Digital Object Identifier (DOI) yordamida iqtibos keltiriladi. VoR imkon qadar tezroq Erta ko'rinishda onlayn nashr qilinadi va tahrirlash natijasida ushbu Qabul qilingan maqoladan farq qilishi mumkin. O'quvchilar VoRni ma'lumotlarning to'g'riligini ta'minlash uchun nashr etilganda quyida ko'rsatilgan jurnal veb-saytidan olishlari kerak. Mualliflar ushbu Qabul qilingan maqolaning mazmuni uchun javobgardirlar. VoR ga havola: https://doi.org/10.1002/chem.202001370 01/2020 Machine Translated by Google 10.1002/chem.202001370 Kimyo - Yevropa jurnali 1 Ushbu maqola mualliflik huquqi bilan himoyalangan. Barcha huquqlar himoyalangan. Yang Yu[ab] va Martina Delbianko* [a] Qabul qilingan qoÿlyozma MINIRIZA Oligosakkaridlarning konformatsion tadqiqotlari Machine Translated by Google Kimyo - Yevropa jurnali 2 Ushbu maqola mualliflik huquqi bilan himoyalangan. Barcha huquqlar himoyalangan. 10.1002/chem.202001370 Y. Yu, doktor M. Delbianko Biomolekulyar tizimlar bo'limi Maks-Plank-Kolloidlar va interfeyslar instituti Am Mühlenberg 1, 14476 Potsdam, Germaniya E-mail: martina.delbianco@mpikg.mpg.de Y. Yu Kimyo va biokimyo kafedrasi Freie Universität Berlin Arnimallee 22, 14195 Berlin, Germaniya [b] [a] Bu erda biz glikanlarning konformatsion tahlili sohasida olingan so'nggi natijalarni ko'rib chiqamiz. Biz glikanlarning to'rtta sinfini va ularning tuzilish xususiyatlarini muhokama qilamiz. Xarakterlashda yordam berish uchun ishlatilgan sintetik strategiyalarga alohida e'tibor beriladi. 1,6-bog'lanish uchun qo'shimcha burilish burchagi ÿ (O6-C6-C5-O5) talab qilinadi. X-nurli kristallografiya [4] va kriyoelektron mikroskopiya (kriyo-EM) [5] kabi analitik usullar sub-nanometrli piksellar sonini olish imkonini berdi. Bundan tashqari, doiraviy dikroizm (CD) va NMR kabi spektroskopik usullar ko'pchilik kimyo laboratoriyalarida tizimli tadqiqotlarni odatiy holga keltirdi.[6] Ushbu natijalar dizayn bo'yicha materiallarning (masalan, DNK origami va de-novo oqsillari) ishlab chiqarilishini bashorat qila oladigan va taklif qiladigan yuqori aniqlikdagi hisoblash vositalarini ishlab chiqish va tasdiqlash imkonini berdi .[7] Glikanlarning konformatsiyasini ko'rib chiqishda monosaxarid birligi odatda qattiq blok sifatida ko'rib chiqiladi.[15a] Glikozid bog'lanishning geometriyasi fundamental ahamiyatga ega bo'lib, u standart deskriptorlar yordamida aniqlanadi (1-rasm). Ikki burilish burchagi glikozid bog'i orqali bog'langan ikkita monosaxaridning nisbiy yo'nalishini belgilaydi: F (H1-C1-Ox-Cx) va P (C1-Ox- Cx-Hx). Uglevodlarni strukturaviy tahlil qilishda qo'shimcha muammo shundaki, standart tavsiflash usullari ko'pincha qo'llanilmaydi.[8b] Uglevodlarning yuqori moslashuvchanligi rentgen nurlari tahlili uchun mos bo'lgan monokristallarning shakllanishiga to'sqinlik qiladi, elektron nurlarga sezgirlik ularni EM xarakteristikasi uchun yomon nomzod qiladi. , va xromoforlarning etishmasligi standart CD tahlilini oldini oladi. NMR eng foydali tavsiflash usuli bo'lib qolmoqda; ammo, tahlilga jiddiy kimyoviy siljish degeneratsiyasi to'sqinlik qiladi, bu ko'pincha maxsus impulslar ketma-ketligini yoki yorliqlarni kiritishni talab qiladi.[14] Tasdiqlash standartlari yo'qligi sababli, hisoblash vositalari peptidlar va nuklein kislotalarga qaraganda ancha kam rivojlangan.[15] Bugungi kunga kelib, kimyoviy sintez, NMR tahlili va molekulyar dinamika (MD) simulyatsiyalarining kombinatsiyasi ba'zi glikan sinflari uchun umumiy bo'lgan takrorlanuvchi struktura xususiyatlarini aniqlashga imkon berdi.[13a, 16] . Molekulaning vazifasi uning uch oÿlchamli shakli bilan mustahkam bogÿlangan. [1] Oqsillar va nuklein kislotalarning strukturaviy tadqiqotlari sintetik va genlarni ifodalash texnologiyalari bilan ta'minlandi.[2] Aniq belgilangan sintetik materiallar aniq struktura-funksiya korrelyatsiyasini o'rnatish uchun standartlar bo'lib xizmat qiladi.[3] maqsadli oqsilga yuqori afiniteye ega bo'lgan tizimli ishlab chiqilgan glikomimetikalar bunday yondashuvning imkoniyatlarini ko'rsatadi.[13] Bundan farqli o'laroq, tabiatda eng ko'p uchraydigan organik moddalar bo'lgan uglevodlarning strukturaviy tadqiqotlari kam uchraydi.[8] Uglevodlar asosan tabiiy manbalardan olinadi, natijada aralashmalarning noto'g'ri aniqlangan aralashmalari paydo bo'ladi.[9] Kimyoviy sintez izolyatsiyaga to'g'ri alternativa taklif qiladi, lekin katta sintetik kuch talab qiladi. Bitta qozonli sintez va avtomatlashtirilgan texnikaning paydo bo'lishi tarkibiy tadqiqotlar uchun ideal zondlar sifatida tegishli birikmalar to'plamlariga kirish imkonini berdi. [10] Tarkibi, uzunligi va almashinishi aniqlangan oligosakkaridlar endi strukturaviy tushuntirish uchun mavjud. Muhimi, NMR faol yadrolari (ya'ni 13C va 19F) kabi o'ziga xos modifikatsiyalarni kiritish osonlik bilan amalga oshirilishi mumkin, bu tahlil davomida katta afzallik beradi.[10b, 11] Muayyan konformatsiyalarni bloklashi yoki muayyan geometriyalarni buzishi mumkin bo'lgan g'ayritabiiy funksiyalar bo'lishi mumkin. tasavvur qilingan va glikomimetikani yaratish uchun ishlatilgan.[12] Garchi bunday strategiyalar sintetik muammolar bilan cheklangan bo'lsa ham, misollar Download 1.6 Mb. Do'stlaringiz bilan baham: 
|