Yilda Nature jurnalida Jeyms Uotson

Neyrospora hujayralari ham aminokislotalar va vitaminlarning to'liq to'plamini o'z ichiga olgan to'liq muhitda baxtli o'sadi . Ularga yashash uchun to'liq vosita kerak emas.Agar genlar biokimyoviy fermentlar bilan bog'langan bo'lsa, Bidl va Tatum minimal muhitda o'sish uchun zarur bo'lgan o'ziga xos fermentlarni (va shunday qilib, o'ziga xos yo'llarni) "buzadigan" mutatsiyalarni yoki genlardagi o'zgarishlarni qo'zg'atish mumkin bo'lishi kerak deb o'ylashdi . Bunday mutatsiyaga ega neyrospora chizig'i to'liq muhitda normal o'sadi, lekin minimal muhitda omon qolish qobiliyatini yo'qotadi.


11. Genetika - bu genlarni va ularning irsiyatdagi rollarini o'rganishga ishora qiluvchi atama - boshqacha aytganda, ma'lum xususiyatlar yoki holatlarning avloddan ikkinchisiga o'tish usuli. Genetika genlar va ularning ta'sirini ilmiy tadqiq qilishni o'z ichiga oladi. Genlar (irsiyat birliklari) hujayralar faoliyatini va tananing funktsiyalarini boshqaradigan oqsillarni yaratish bo'yicha ko'rsatmalarni o'z ichiga oladi. Genetik yoki irsiy kasalliklarga misollar: Mukovistsidozni o'rganish (Qarang: Kistik fibroz haqida o'rganish ), Xantington kasalligi ( Hantington kasalligi haqida o'rganish ) va fenilketonuriya (PKU) ( Fenilketonuriya haqida o'rganish ).
Genomika - bu insonning barcha genlarini (genom), shu jumladan, bu genlarning bir-biri bilan va insonning atrof-muhit bilan o'zaro ta'sirini o'rganishni tavsiflovchi yangi atama. Genomika yurak kasalliklari, astma, diabet va saraton kabi murakkab kasalliklarni ilmiy o'rganishni o'z ichiga oladi, chunki bu kasalliklar odatda individual genlardan ko'ra genetik va atrof-muhit omillarining kombinatsiyasidan kelib chiqadi. Genomika ba'zi murakkab kasalliklarni davolash va davolash uchun yangi imkoniyatlarni, shuningdek, yangi diagnostika usullarini taklif qilmoqda.

12. O'simliklardagi SCR o'xshash ( SCR) genlar oilasiKetma-ket o'simliklarning ko'pgina genom annotatsiyalarida kichik peptidlarni kodlaydigan genlar muntazam ravishda e'tiborga olinmaydi. Ushbu genlarni, shu jumladan SCR-ga o'xshash (SCRL) ajratilgan peptidlarni kodlaydigan genlarni aniqlashdagi qiyinchilik, birinchi navbatda, genlarni aniqlash algoritmlari ko'pincha ekspressiv dalillar mavjud bo'lmagan kichik ORFlarni ( < 50 aminokislotalarni kodlash) e'tiborsiz qoldirishidan kelib chiqadi. Ayniqsa, SCRLlarni aniqlash ikkita qo'shimcha qiyinchiliklarni keltirib chiqaradi. Birinchisi, SCRL genlarining gen tuzilishi bilan bog'liq bo'lib, unda boshlang'ich ATG kodoni bilan signal ketma-ketligi kodlash mintaqasining qolgan qismidan intron bilan ajratiladi. Ikkinchi qiyinchilik SCR ekanligidan kelib chiqadi) va ketma-ketlik homologiyasiga asoslangan standart qidiruvlar tegishli ketma-ketliklarni aniqlash uchun mos emas. Shunga qaramay, tBLASTN dasturi bilan takroriy izlanishlar natijasida yetti xil SCR allellari va Brassicadan olingan uchta gulchang qoplami oqsillari ketma-ketligidan foydalangan holda 28 genom signal peptidini , saqlanib qolgan sistein qoldiqlarini, G x C2 motifidagi glitsinni o'z ichiga olgan ORFlarni kodlashi taxmin qilinmoqda. va ko'pchilik SCRlarda topilgan C3xxxY/F motividagi aromatik aminokislota ( ) . Biroq, uchta SCRLda ushbu saqlanib qolgan qoldiqlarning bir qismi yo'q va ular ishlamaydi deb taxmin qilinadi. SCRL genlarining katta qismi genomda tandemda joylashgan va bu chambarchas bog'langan genlar nisbatan yuqori ketma-ketlik o'xshashligiga ega, bu ularning ortiqcha funktsiyalarga ega bo'lishi mumkinligini ko'rsatadi.

13. Genxaritalash yoki genomxaritalash xromosomadagi genning joylashishini va genlr orasidagi masofani aniqlash uchun ishlatiladigan usullarni tavsiflaydi . ^[2] [3] Gen xaritasi gen ichidagi turli joylar orasidagi masofani ham tasvirlashi mumkin.
Barcha genom xaritalashning mohiyati molekulyar belgilar to'plamini genomdagi tegishli pozitsiyalariga joylashtirishdir. Molekulyar belgilar har qanday shaklda bo'ladi. Genlar genom xaritalarini tuzishda genetik belgilarning maxsus turi sifatida ko'rib chiqilishi mumkin va boshqa markerlar kabi xaritaga tushirilishi mumkin. Ba'zi tadqiqot sohalarida gen xaritasi organizmda yangi rekombinantlarni yaratishga yordam beradi.


14. Genetik xaritani yaratish uchun tadqiqotchilar ma'lum bir kasallik yoki xususiyat keng tarqalgan oila a'zolaridan qon yoki to'qimalar namunalarini yig'adilar. Turli laboratoriya usullaridan foydalangan holda, olimlar DNKni ushbu namunalardan ajratib olishadi va uni faqat kasallik yoki xususiyatga ega bo'lgan oila a'zolarida kuzatiladigan noyob naqshlar uchun tekshiradilar. DNKni tashkil etuvchi kimyoviy asoslardagi bu xarakterli naqshlar markerlar deb ataladi.
DNK belgilari o'z-o'zidan kasallik yoki belgi uchun mas'ul bo'lgan genni aniqlamaydi; ammo ular tadqiqotchilarga gen xromosomaning qayerda joylashganligini taxminan ayta oladilar.
Shuning uchun: tuxum yoki sperma paydo bo'lganda, odamning genomini tashkil etuvchi juftlashgan xromosomalar DNKni almashadi. Buni rekombinatsiya deb ataladigan aralashish jarayoni deb tasavvur qiling. Reproduktiv hujayradagi bitta xromosomada DNKning bir qismi onadan, bir qismi esa otasidan meros bo'lib o'tgan.
Agar ma'lum bir gen DNK belgisiga yaqin bo'lsa, gen va marker rekombinatsiya jarayonida birga qoladi va ular ota-onadan bolaga birga o'tadi. Agar ma'lum bir kasallik yoki xususiyatga ega bo'lgan har bir oila a'zosi ma'lum bir DNK belgisini meros qilib olsa, kasallik uchun mas'ul bo'lgan gen ushbu markerga yaqin joylashgan bo'lishi mumkin.
Genetik xaritada DNK belgilari qanchalik ko'p bo'lsa, kamida bitta marker kasallik geniga yaqin joylashishi ehtimoli shunchalik yuqori bo'ladi va tadqiqotchilar uchun bu genni nolga kiritish osonroq bo'ladi. HGP ning birinchi yirik yutuqlaridan biri butun inson genomi bo'ylab teng ravishda joylashgan markerlarning zich xaritalarini ishlab chiqish edi.
15. Sekvinirlanuvchi qismlarning o’lchami turli-tuman bo’lishi mumkin va, odatda, 100 yoki 1000 juft nukleotidlardan yoki undan katta bo’lishi mumkin. Sekvinirlash natijasida genning ma’lum qismlari, to’liq gen, RNK genlari yoki hatto organizmning to’liq genomi ketma-ketligini aniqlash mumkin. Sekvenirlashuslublari. Sekvinirlash uchun bir necha xil (Senger, Maksam-Gilbert va boshka) uslublardan foydalaniladi. Hozirgi vaqtda genlarni sekvinirlash uchun, asosan, didezoksinukleozidtrifosfatlarni (ddNTP) qo’llashga asoslangan Senger uslubidan foydalaniladi. Odatda, sekvinirlashdan oldin ketma-ketligi aniqlanishi zarur bo’lgan DNK uchastkasining PZR yordamida amplifikasiyasi amalga oshiriladi. Agar genomning to’liq ketma-ketligi aniqlanishi zarur bo’lsa, sekvinirlashning yangi avlod texnologiyasidan (next-generation sequencing) foydalaniladi. «Plyus-minus» metodi. «Plyus-minus» metodi birinchi marta 1975 yilda F.Senger va A.Koulson tomonidan taklif etilgan va fermentativ reaksiyalarga asoslangan. Bu usul genomning o’rganilayotgan qismiga mos keluvchi bir zanjirli DNK fragmentini ajratishni nazarda tutadi. Bu fragment keyinchalik polimeraza-ko’paytirish uchun matrisa sifatida foydalaniladi. Bunda praymer sifatida sintetik oligonukleotidlar yoki ma’lum restrikzalar yordamida gidrolizlangan tabiiy subfragmentdan foydalaniladi. «Plyus-minus» metodining bosqichlari: 1.Birinchi bosqichda DNK polimeraza yordamida 4 xil nukleotidlar ishtirokida polimerizasiya reaksiyasi amalga oshiriladi. Bunda bitta nukleotid radioaktiv nishonlangan bo’ladi. O’rganilayotgan bir zanjirli DNK fragmentining to’liqsiz kopiyalari to’plamlarini olish maqsadida reaksiya cheklangan sharoitda o’tkaziladi. 2. Keyin polimerlar to’plami nukleotidlardan ajratiladi, aralashma 8 qismga ajratiladi va qo’shimcha polimerizasiya reaksiyalari davom ettiriladi. Qo’shimcha polimerizasiya reaksiyalari bitta nukleotid ishtirokisiz, 3 xil nukleotid ishtirokida («minus» sistema) yoki faqat bir xil nukleotid ishtirokida («plyus» sistema) o’tkaziladi. 3 xil nukleotid ishtirokida borayotgan reaksiyada («minus» sistema) matrisaga komplementar sintezlanayotgan barcha yangi zanjirlarda reaksiya aralashmada mavjud bo’lmagan eng yaqin nukleotidga borganda to’xtaydi. «Plyus» sistemada reaksiya aralashmada mavjud nukleotid joylashgan ketma-ketlikdan so’ng to’xtaydi. 3. 8 ta namunadan olingan aralashma bir vaqtning o’zida yuqori aniqlikdagi elektroforezdan o’tkaziladi. Elektroforez geli radioavtografiya qilinadi va radioavtografiyadan nukleotidlar ketma-ketligi o’qiladi. O’qilgan yakuniy ketma-ketlik dastlabki matrisaga komplimentar bo’ladi. Sengerning didezoksi-metodi. «Plyus-minus» metodining kamchiligi shundaki, 1-bosqichda aniq statistik kopiyalar tuplamlarni olish juda qiyin. Shu sababli 1977 yilda Senger boshchiligida yangi uslub ishlab chiqildi. Bu usul didezoksinukleozidtrifosfatlar usuli deb nomlandi. Hozirgi vaqtda u Sengerning didezoksi-metodi nomi bilan yuritiladi. Bu usul asosida ham praymerning 3’-uchidan boshlanadigan DNK bir zanjirini polimeraza ishtirokida nusxasini olish yotadi. Polimerlanish reaksiyasi aralashmasida 4 xil nukleotidlar (dNTP) mavjud va ularning bittasi ³²R atomi bilan nishonlangan.


16. Sink-barmoq va TALE oqsillarining modulli sifatlari, CRISPR-Cas9 ning DNKni tanib olishning yuqori moslashuvchan qobiliyatiga qo'shimcha ravishda, tadqiqotchilarga ularning transkripsiyaga sintezi orqali promotor yoki kuchaytiruvchi ketma-ketlikdagi deyarli har qanday genning ifodasini modulyatsiya qilish imkoniyatini beradi. faollashtiruvchi va repressor oqsil domenlari. Ishlab chiqariladigan birinchi to'liq sintetik transkripsiya effektor oqsillari orasida ( Beerli va boshq. 1998 ) muhandislik sink-barmoq oqsillarini Herpes simplexdan olingan transaktivatsiya domeni ( Sadowski va boshq. 1988 ) yoki Krüppel- bilan birlashtirishga asoslanganlar edi. bog'langan quti (KRAB) repressiya oqsili ( Margolin va boshq. 1994).). Keyingi 15 yil davomida sink-barmoqqa asoslangan transkripsiya modulyatorlari kengaytirildi va bir nechta boshqa turdagi effektor domenlari ( Beerli va Barbas 2002 ), jumladan, masalan, Dnmt3a metiltransferaza domeni ( Rivenbark va boshq. 2012 ; Siddique ) mavjud edi. va boshq. 2013 ) va o'n-o'n bir translokatsiya metilsitozin dioksigenaza 1 (TET1) ( Chen va boshq. 2014 ), navbati bilan maqsadli metilatsiya yoki demetilatsiya orqali transkripsiyani modulyatsiya qilishi mumkin. Sink-barmoq transkripsiyasi omillarining tabiiy kengayishi va sink-barmoq oqsillari bilan parallelliklarga asoslanib, TALE transkripsiya omillari maqsadli transkripsiya modulyatsiyasiga erishish uchun ayniqsa samarali platforma sifatida paydo bo'ldi.Miller va boshqalar. 2011 yil ; Chjan va boshqalar. 2011 ). Effektor domenlari odatda sintetik TALE massivining karboksil terminali bilan birlashadi va odatda sink-barmoq transkripsiyasi omillari bilan samarali modulyatsiya qilish uchun zarur bo'lgan uzunroq ketma-ketlikdan farqli o'laroq, TALElar gen ekspressiyasini 10,5 martagacha takrorlash bilan tartibga solishi haqida xabar berilgan (Boch va boshqalar) . boshq. 2009 ). Sink barmoqlari singari, TALElar ham ko'plab epigenetik modifikatorlar, jumladan TET1 gidroksilaza katalitik domeni ( Maeder va boshq. 2013b ) va lizinga xos histon demetilaz 1 (LSD1) ( Mendenhall va boshq. 2013 ) bilan mos keladi.) maqsadli CpG demetilatsiyasi va giston demetilatsiyasi uchun ishlatilgan domenlar. Xususan, ko'p sonli TALElarni yaratishning qulayligi sintetik transkripsiya omillari kombinatsiyasi bilan promotorlar ketma-ketligini qo'shish gen ekspressiyasining sinergik o'sishiga olib kelishi mumkinligini aniqlashga imkon berdi (Maeder va boshq. 2013b; Perez-Pinera va boshqalar . boshq. 2013 ). Va sink barmoqlari kabi ( Beerli va boshq. 2000b ; Pollock va boshq. 2002 ; Magnenat va boshq. 2008 ; Polstein and Gersbach 2012 ), TALE faollashtiruvchilari ham tashqi ta'sirga javoban gen ifodasini tartibga solish uchun muvaffaqiyatli ishlab chiqilgan ( Mercer va boshq. 2014 ) yoki endogen (Li va boshqalar. 2012 ) kimyoviy ogohlantirishlar, optik signallar ( Konermann va boshq. 2013 ) va hatto proteolitik belgilar ( Copeland va boshq. 2016 ; Lonzaric va boshq. 2016 ).


17. Birinchi marta paxta uchun gen (gen-nokaut) faoliyatini pasaytirish texnologiyasi ishlab chiqildi. Ushbu texnologiya 150 dan ortiq mamlakatda patentlar bilan himoyalangan, 2014 yilda O'zbekistonning ilm tarixida ilk marotaba Nature Communications nufuzli xalqaro jurnali (http://www.nature.com/ncomms/index.html) ushbu texnologiya tafsilotlari bilan maqola chop etdi. Ushbu texnologiyadan orqali tashqi genlardan foydalanmasdan "Porloq-1", "Porloq-2", "Porloq-3" va "Porloq-4" yuqori sifatli tola navlari yaratildi. Porloq navlari 60 ming gektardan ortiq maydonda ekildi. Shuningdek, dunyodagi birinchi marta DNK marker texnologiyasidan foydalanilgan holda yaratilgan tolaning sifati yaxshilangan Ravnaq-1 va Ravnaq-2 yangi navlari sinovdan o'tkazildi.
- Gen-nokaut texnologiyasidan foydalangan holda, yuqori hosil beruvchi kartoshka navlari hamda sovuq va qurg'oqchilikka chidamli paxta liniyalari yaratildi.
- Shunindek paxtaning viltga yuqori chidamli biotexnologik genotiplari olingan.
Markazda 200 dan ortiq ilmiy maqolalar, jumladan, 80 dan ortiq xorijiy nashrlarda chop etilgan. 8 ta monografiya chet elda chop etildi.
2017-yilda AQSh patent va tovar belgilari idorasi gen-nokaut texnologiyasiga patent e'lon qilib, uni boshqa 20 mamlakatda himoya qiladi.
Markazda ishlab chiqilgan yangi "Ravnaq-1", "Ravnaq-2", "Baraka", "Saxovat" va "Tafakkur" paxta navlarini davlat nav sinovlariga taqdim etildi va patentga talabnomalar topshirildi.
2010 yilda Markaz direktori Abdurahmonov I.Yu. Jahon ilmiy fanlar akademiyasining (TWAS) qishloq xo'jaligi fan sohasida erishgan ulkan yutuqlari uchun "TWAS-2010" mukofotiga sazovor bo'ldi. 2013-yilda Paxta bo'yicha xalqaro maslahat qo'mitasining "ICAC 2013 yil tadqiqotchisi" mukofotga loyiq deb topildi.


18. 19-asr boshlarida genetika fani "gen-xususiyat" darajasida G. Mendel tomonidan taniqli fundamental qonunlarning kashf etilishi natijasida rasmiy tan olindi. Genning mavjudligi aniqlangan, ammo uning moddiy tabiati noma‘lum bo‗lib qoldi. Faqat 1950-yillarda DNKning ikki spirali va DNK bo‗lagi sifatida gen kontseptsiyasi paydo bo‗ladi va tezda tasdiqlangandan so‗ng, molekulyar genetikaning, individual genlarning o‗lchamlari, gendagi funktsional hududlar va boshqalar jadal rivojlanishi boshlandi. Bunga parallel ravishda biokimyogarlar genetiklar ishtirokida genetik kodni DNKdan oqsilga o‗tkazish bilan oqsil sintezining matritsali mexanizmini ochib berdilar. Genom – organizm hujayrasida to`plangan irsiy materialning yig`indisidir. Genom organizmni qurish va saqlab turish uchun kerak bo`lgan biologik axborotni saqlaydi. Barcha genomlar, shu jumladan inson genomi va boshqa qolgan barcha hujayrali hayot formasiga ega bo`lgan genomlar DNK dan tuzilgan, lekin ba‘zi bir viruslar genomi RNK dan iborat. Shu bilan birga, ―genom‖ terminining boshqacha talqini ham mavjud. Bunda genom deganda ma‘lum turning genetik materiallari xromosomalarni gaploid to‗plami yig`indisiga tushuniladi. Eukariotlarning genomi hajmi haqida gapirilganda, aynan genomning mana shu talqini haqida tushuniladi. Odamda (Homo sapiens) somatik hujayralar irsiy materiali yadroda joylashgan 23 juft xromosomada (22 juft autosoma va 1 juft jinsiy xromosoma) namoyon bo`ladi. Bundan tashqari hujayra ko`plab nusxadagi mitohondrial DNK ga ega. Odamning 22 juft autosoma, X va Y jinsiy xromosomlari, mitohondrial DNK birgalikda bo`lib taxminan 3,2 mlrd juft asosni tashkil qiladi.


19. XXI asrning boshlanishi molekulyar biologiya va bioinformatika sohasida erishilgan 
ulkan yutuqlar bilan sharaflidir. DNKning alohida qismlarining va turli ko‘rinishdagi 
organizmlarning keng ko‘lamdagi genom ketma-ketliklarini ma’nosini ochishga imkon beruvchi 
DNK asosining ketma-ketliklarini aniqlash uchun avtomatlashtirilgan tizimlarni yaratilishini 
haqli ravishda muhim deb hisoblash mumkin. (Venter et al, 2001.)Inson genomlarini, hayvonlar, 
o‘simliklar, bakteriyalar va viruslar genomlarini sekvenirlash bo‘yicha keng ko‘lamdagi 
loyihalarni amalga oshirish nukleotid ketma-ketliklar to‘g‘risidagi axborotlar hajmini bamisoli 
ko‘chkisimon o‘sishga olib keldi [http://www.ncbi.nlm. nih.gov/Genbank/ genbankstats.html] 
Genetik molekulalarning vazifalari va ularning tuzilishi haqidagi bilimlarning to‘planishi va 
umumlashtirilishi, ularning tahlili molekulyar genetikaning postgenom davridagi birmuncha 
muhim muammolari sirasiga kiradi. Ma’lumotlar bazasida to‘plangan ilmiy tajriba axborotlar va 
DNK ketma-ketliklari tahlili asosida kompyuter dasturlari yordamida yangi genlarning vazifaviy 
qisqa ma’lumoti ushbu muammoni echishga yondashuvlardan biridir. 
So‘nggi 10-15 yillar mobaynida ilmiy jamiyatlar DNK ketma-ketliklarini to‘plashga 
kuchli e’tibor qaratmoqdalar va taxminan 310 nukleotid juftdan iborat bo‘lgan inson 
genomining aniqlangani ushbu faoliyatning cho‘qqisi bo‘ldi [Venter et al, 2001] Ayni paytda 
ma’lumotlarning asosiy molekulyar-genetik bankida [EMBL, GenBank, DDBJ] 
mikroorganizmlar to‘la sekvenirlangan 180 ta genomlari va inson genomlarini ham qo‘shganda 
o‘nlab eukariot genomlar to‘g‘risida ma’lumotlar to‘plab bo‘lingan, boz ustiga aniqlangan 
ketma-ketliklar hajmi shitob bilan o‘sib bormoqda.[
http://www.ncbi.nhn.nih.gov/
genomes/ 
MICRO-BES /Complete.html] Fan uchun, tibbiyot va inson hayotining boshqa jabhalari uchun 
olingan axborotlar qiymatini ortiqcha baholab bo‘lmaydi. Biroq, ushbu axborotdan samarali 
foydalanish uchun uning biologik mazmunini tushunish, ketma-ketlik vazifasini belgilash, 
ularning tartibga solishdagi rolini va o‘zaro tadrijiy munosabatlarini aniqlash zarur. Ayni paytda 
ulkan miqdordagi DNK ketma-ketliklari va aminokislotalar ulkan mehnat talab qilgani va 
salmoqli qiymatga ega bo‘lgani bois, ularni izlash, qiyoslash, xaritalash uchun ilmiy tajriba 
uslublarni shunchaki to‘g‘ridan-to‘g‘ri qo‘llab bo‘lmaydi. Birinchi navbatdagi vazifa zamonaviy 
kompyuter texnologiyalariga biopolimerlarni jalb etish va DNK, RNK va oqsillar kabi genetik 
makromolekulalar ketma-ketligini tahlil qiluvchi kompyuter dasturlari va matematik algoritmlar 
yaratishdan iborat. SHaxsiy kompyuterlarda genetik ma’lumotlarni tahlil qilish dasturidan 
foydalanishning qulayligi va ulkan hajmdagi ma’lumotlarga ishlov berish imkoniyati 
bioinformatiklarning tajriba ishida zarur vosita bo‘lib xizmat qiladi. Tirik hujayralarda 
o‘tayotgan barcha molekulyar jarayonlar to‘g‘risidagi bilimlarga to‘la ega bo‘lmaganligimiz 
bois, DNK, RNK va oqsillar ketma-ketligini tahlil qilish uchun matematik uslublar tajribaviy 
uslublarning o‘rnini bosa olmaydi. Biroq kompyuter uslublarida ixtisoslashgan ma’lumotlar 
bazasida to‘plangan DNK ketma-ketliklari to‘g‘risidagi ulkan miqdordagi ilmiy tajriba 
ma’lumotlar genomlar tuzilishi va tadriji haqidagi sifat jihatdan yangi bilimlarni olishning 
imkonini beradi. [Kanehisa and Bork, 2003; Galperin, 2004]Aynan genom ma’lumotlarining
statistik tahlili asosida genetik axborotni tashkil etish to‘g‘risidagi yangi bilimlarga ega bo‘lish 
mazkur ishda tavsiya etilgan kompyuter tadqiqotlarining asosiy maqsadidir. XXI asrning 
boshlarida DNK va oqsillar ketma-ketligining tuzilishi va xossasini o‘rganishga yo‘naltirilgan 
dasturiy mahsulotlarning keng doirasi yaratildi. [Kolchanov, 1988; Wang et al, 1999; Pevzner, 
2000; Momit, 2001; Koonin and Galperin, 2002]Bu dasturlarga joylashtirilgan ko‘plab 
algoritmlar texnikasini biopolimerlar ketma-ketligini qurishda statistik xossalar va 
qonuniyatlarni tadqiq qilish uchun diskret matematikada [Gusfield, 1997] hamda matematik 
statistika va ehtimollar nazariyasida qo‘llash muhim ahamiyat kasb etadi. Ketma-ketliklar 
o‘zgarishining tadrijiy cheklovini hisobga oluvchi matematik baholash yordamida genetik 
ma’lumotlar murakkabligining tahlilini o‘tkazish muhim muammolardan biridir. 
20. Epigenetika DNK ketma-ketligi mutatsiyalari natijasida to'g'ridan-to'g'ri kelib chiqmagan gen ekspressiyasidagi o'zgarishlar bilan shug'ullanadi, bu avlodlar va avlodlar orasida irsiy xususiyatlarning shakllanishiga olib keladi. Keling, asalari uyasini tasavvur qilaylik. Uyadagi barcha asalarilar genetik jihatdan bir xil. Xo'sh, ishchi asalarilar, askar asalarilar va malika asalarilar bir xil genomdan qanday paydo bo'ladi? Javob dietada yotadi: gulchangni qabul qiladigan lichinkalar ishchi asalarilarga aylanadi, shohona sutini olganlar esa malika bo'ladi. Qanday qilib bu mumkin?
Bu erda epigenetik hodisa nimadan iboratligini tushuntirish zarurati tug'iladi. Epigenetikaning eng qiziqarli mexanizmi bu DNK metilatsiyasi, ya'ni DNK ichidagi nukleotidlarga (komponentlar - A, T, C va G) kichik "marker" ni biriktirishdir. Giston modifikatsiyalari epigenetikada yana bir muhim mexanizmdir. Ammo gistonlar nima? Bular bizning DNKning to'g'ri fazoviy tuzilishini saqlashga yordam beradigan oqsillardir. Gistonga "marker" qo'shilishi DNK strukturasini mahalliy darajada bo'shatadi va shu bilan molekulaning ushbu qismini ishlatish imkoniyatini oshiradi.


21. n vitro (lotincha shisha ichida) tirik organizmdan tashqarida boshqariladigan muhitda berilgan protsedurani bajarish texnikasini anglatadi. Hujayra biologiyasida ko'plab tajribalar organizmlar yoki hujayralar tashqarisida o'tkaziladi. In vitro tajribalarining doimiy zaif tomonlaridan biri shundaki, ular organizmning, xususan mikrobning aniq hujayra sharoitlarini takrorlay olmaydi. Ko'pchilik orasida bir misol keltirish uchun, lizatlar yoki madaniy o'stirilgan spiroketalardan olingan ekstraktlar sutemizuvchilar borreliyasida ifodalangan antijenlarni aks ettirmaydi :
Bu savolga javob berish, kulturada yetishtirilgan spiroxetalarning oqsil ifodasi xossadagi Borreliyaga to‘liq o‘xshamasligi bilan murakkablashadi , ya’ni madaniyatda yetishtirilgan bakteriyalar oqsil lizatlarining foydaliligi ELISPOT tahlili uchun antigen manbai sifatida cheklangan.