194-guruh talabasi Nurullayev Davronning Bioinformatika fanidan

Mavzuning dolzarbligi: MMDB endi biologik yig'ilishlarni/komplekslarni yoki "biologik birliklar" ni kuzatib boradi, chunki ular tuzilmaning sarhisob sahifalarida chaqiriladi va sukut bo'yicha manba ma'lumotlarida ro'yxatga olingan birinchi yoki standart biologik birlikni ko'rsatadi. Xulosa sahifalarining yuqori qismida, asosiy iqtibos ostidagi navigatsiya yordami yozuvning uch xil ko'rinishini taqdim etadi: (i) standart biologik birlik; (ii) barcha biologik birliklar ro'yxati, shu jumladan, biologik yig'ilishning xom ma'lumotlarda mavjud bo'lgan bir nechta nusxalarini va/yoki biologik yig'ilishning turli talqinlarini ifodalashi mumkin bo'lgan standart; va (iii) omonatchi tomonidan Protein ma'lumotlar bankiga taqdim etilgan ma'lumotlar to'plami sifatida assimetrik birlik. Ko'rinishlar almashtirilganda, sahifadagi batafsil taqdimot, ma'lumotlarni yuklab olish va vizualizatsiya qilish imkoniyatlari farq qilishi mumkin.


Ishning maqsadi:
Ketma-ketliklarni bu tarzda taqqoslash molekulyar biologiyada keng tarqalgan. Tekislashtirish evolyutsion jarayonni aks ettiradi deb taxmin qilinadi. Bir-birini ostida turuvchi ketma-ketliklar ajdod-ketma-ketlik ramziga mos keladi. Ketma-ketliklar evolyutsiyasi qanday yo’nalishda borganligini aniq aytib bera olmaymiz. Shuning uchun, “to’g’ri” ketma-ketlik tariqasida sifat vazifalari bo’yicha nisbatan optimal tekisliklar olinadi. Ammo, ushbu tanlangan vazifaning haqiqatdan ham to’g’ri ekanligini qanday nazorat qilish mumkin, nisbatan yaqin bo’lgan etalonlar bormi? Etalon tariqasida ularning fazoviy strukturasini o’rnini nisbatan to’laroq to’ldirishga mos keluvchi tekisliklar olinishi mumkin (bunday strukturalar bir necha yuz oqsillar uchun aniqlangan).


Ishning vazifalari:

• 
  Biologik ketma-ketliklarning juftlik taqqoslanishi haqida o’rganish;
  
• 
  Biologik ketma-ketliklarning juftlik taqqoslanishi bilan tanishish;
  
• 
  Biologik ketma-ketliklarning juftlik taqqoslanishi bilan ishlash haqida o’rganish;
  
• 
  Yig’ilgan ma’lumotlarni umumlashtirish va xuloslash.