Базы и банки данных. Лекция №2

Биоинформатикаni genomikadagi roli

qiyosiy genomikada kompyuterning matematik usullari (genom bioinformatikasi);
oksil tuzilmalarini boshqarish uchun algoritm va dasturlarni ishlab chiqish (strukturaviy bioinformatika);
barqarorlashtirish uslublari strategiyasi bo'yicha umumiy axborot vositalarining biologik tizimlar barqarorligi.
Genomika, transkriptomika va proteomika;
Rivojlanish biologiyasida kompyuter modelini boshqarish;
Gen tarmoqlarining kompyuterlarini boshqarishi;
Populatsion genetikada modellashtirish.

Proteomika

Proteomika tez va sezgir texnologiya bo'lib, yuqori proteomni qamrab oladi. Ekspressiya proteomikasi, funktsional proteomika va strukturaviy proteomika proteomikaning uchta asosiy turidir. Proteomikada ikki xil ish jarayoni mavjud: yuqoridan pastga va pastdan yuqoriga proteomika. Bundan tashqari, ko'pgina biologiya fanlarida proteomikadan foydalanish tobora ortib bormoqda. Nihoyat, proteomika turli kasalliklar va kasalliklarda yangi biomarkerlarni topishga yordam beradi
Proteomika - bu oqsillarni keng ko'lamli o'rganish.[1][2] Proteinlar tirik organizmlarning muhim qismlari bo'lib, mushak to'qimalarining strukturaviy tolalarini hosil qilish, oziq-ovqatni fermentativ hazm qilish yoki DNKning sintezi va replikatsiyasi kabi ko'plab funktsiyalarga ega. Bundan tashqari, oqsillarning boshqa turlariga organizmni infektsiyadan himoya qiluvchi antikorlar va butun tanaga muhim signallarni yuboradigan gormonlar kiradi.
Proteoma - bu organizm yoki tizim tomonidan ishlab chiqarilgan yoki o'zgartirilgan oqsillarning butun to'plami. Proteomika oqsillarning tobora ortib borayotgan sonlarini aniqlash imkonini beradi. Bu vaqt va hujayra yoki organizm duch keladigan aniq talablar yoki stresslarga qarab o'zgaradi.[3]
Proteomika fanlararo soha bo'lib, u turli genom loyihalari, jumladan, Inson genomi loyihasining genetik ma'lumotlaridan katta foyda olgan.[4] U protein tarkibi, tuzilishi va faoliyatining umumiy darajasidan proteomalarni o'rganishni o'z ichiga oladi va funktsional genomikaning muhim tarkibiy qismidir.
Proteomika odatda oqsillar va proteomalarning keng ko'lamli eksperimental tahlilini bildiradi, lekin ko'pincha oqsillarni tozalash va massa spektrometriyasiga ishora qiladi. Darhaqiqat, mass-spektrometriya proteomalarni tahlil qilishning eng kuchli usuli bo'lib, millionlab hujayralardan tashkil topgan katta namunalarda ham, bitta hujayradagi organoid oqsillargacha tahlil qiladi.