Klonlash uchun primer dizayni
ExPASy tarjima vositasi haqida batafsil ma’lumot uchun ExpASy Portal).
• Agar proteinga aylantirilmaydigan genlardan oldin yoki keyin qo‘shimcha transkripsiyalangan ketma-ketlik mavjud bo‘lsa, biz o‘sha qo‘shimcha tarjima qilinadigan ketma-ketliklarni olib tashlashimiz kerak.
• To‘liq tarjima qilingan kadrni olgandan so‘ng, maqsadli ketma-ketlikni Ms-word-ga joylashtiring, dastlabki 18 nukleotid yoki bps oldinga primer sifatida xizmat qiladi. Shu bilan birga, oxirgi 18 nukleotid teskari komplementda ko‘chiriladi va joylashtiriladi va hosil qilingan ketma-ketlik teskari primer sifatida xizmat qiladi.
• (Osonlik uchun dastlabki 18 va oxirgi 18 nukleotidni ajratib ko‘rsating)
ATGGAGGGATATGATAATGGGTCGTTGTATGCTCCTTTTTTGTCGTTGAAATCTCATTCGAAACCAGAGCTGCATCAAGGCGAAGAAGAGAGCTCAAAGGTTAGATCAGAAGGTTGTTCGAAAAGCGTGGAGTCGTCGAAAAAGAAGGGGAAGAAACAAAGGTATGCGTTTCAAACAAGGAGCCAAGTGGATATTCTTGATGATGGTTATCGATGGAGGAAATATGGCCAAAAGGCCGTCAAGAACAACAAGTTCCCTAGGAGTTACTATAGGTGTACATATGGAGGATGCAATGTGAAGAAGCAAGTGCAAAGATTAACAGTGGACCAAGAAGTGGTCGTGACAACCTACGAAGGAGTGCATTCGCATCCCATCGAGAAATCCACCGAAAACTTCGAGCATATTCTCACTCAAATGCAAATCTACTCTTCTTTCTAG
Oldingi zanjir: ATGGAGGGATATGATAAT
Teskari zanjir: ATCTACTCTTCTTTCTAG
➢Oxirgi 18 nukleotidning teskari komplementi: CTAGAAAGAAGAGTAGAT
Teskari komplement DNK ketma-ketligini uning teskari komplementiga yoki teskari komplementga aylantirish uchun ishlatiladi. Berilgan matn maydoniga FASTA ketma-ketligini joylashtirish orqali siz “yuborish” opsiyasini bosish orqali ketma-ketligingiz uchun teskari to‘ldiruvchini osongina olishingiz mumkin (2-rasm).
2-rasm. Teskari to‘ldiruvchi
Endi butun ketma-ketlik so‘zdan ko‘chiriladi va NEB kesgichda berilgan maydonga quyidagi tarzda yopishtiriladi (3-rasm).
• Davom etish uchun yuborish tugmasini bosing.
3-rasm. NEBda ketma-ketlik kiritish
U CD ketma-ketligidagi cheklash joylarini aniqlash imkonini beruvchi ketma-ketlikning cheklash xaritasini ko‘rsatadi (4-rasm).
Do'stlaringiz bilan baham: |