Resurslararo qidiruv: ma’lumotlar bazalarini parallel ravishda so‘rash
Muntazam qidiruvga qo‘shimcha ravishda, Expasy «resurslar o‘rtasidagi qidiruv»ni taklif qiladi, bu esa parallel ravishda Internetga kirish mumkin bo‘lgan ma’lumotlar bazalari to‘plamini so‘rash imkonini beradi. Ko‘pgina ma’lumotlar bazalari o‘zlarining qidiruv funksiyalarini taklif qilsalar ham, bitta markazdan ma’lumotlar bazalari to‘plamiga bir vaqtning o‘zida so‘rov qilish qulay variant hisoblanadi. Shu tarzda, qidiruv natijalari foydalanuvchiga noma’lum, ammo tegishli va potentsial foydali manbalarni o‘z ichiga olishi mumkin. ExPASy ning oldingi versiyasida allaqachon kiritilgan ushbu funksiya tegishli veb-xizmat provayderlari yordamida qayta ko‘rib chiqilgan. Endi u ENZYME, MyHits, STRING, UniProtKB, ViralZone, PROSITEva SWISS-MODEL Repository kabi 19 ta SIB maʼlumotlar bazalarini oʻz ichiga oladi. Standart xatti-harakatlarga qo‘shimcha ravishda (ya’ni, to‘liq matnli qidiruv), qidiruv tizimi UniProtKB kirish raqamlari, PDB identifikatorlari yoki Ensembl identifikatorlari kabi formatlangan ma’lumotlarning ma’lum turlarini avtomatik ravishda taniydi.Natijada, u so‘rovni faqat belgilangan so‘rov turini qo‘llab-quvvatlaydigan manbalarga yuboradi.Bu nafaqat qidiruv vaqtini optimallashtiradi, balki tegishli natijalarni ham beradi.
Maʼlumotlar bazasi nomi, URL, tavsifi
SWISS-MODEL ombori https://swissmodel.expasy.org/repository Protein tuzilishi homologiyasi modellari
SwissDock http://www.swissdock.ch/ Protein faol joylariga kichik ligandlarning biriktirilishi
MetaNetX https://www.metanetx.org/ Metabolik tarmoq ombori va tahlili
Cellosaurus https://web.expasy.org/cellosaurus/ Hujayra liniyalari bo‘yicha bilim manbai
Bgee https://bgee.org/ Gen ifodasi bo‘yicha ekspertiza
OMA https://omabrowser.org/oma/home/ To‘liq genomlar orasida ortologiya xulosasi
Selectome https://selectome.org/ Ijobiy tanlov ma’lumotlar bazasi
miROrtho http://cegg.unige.ch/mirortho Hayvonlarning mikroRNK genlari katalogi
Do'stlaringiz bilan baham: |
