Kirish I bob. Oqsil strukturalarini va uning modellari

Batafsil ko‘rinish
Bosh sahifada yoki natija sahifasida kartani bosish mos keladigan manbaning batafsil ko‘rinishini ko‘rsatadi.
10-rasmda barcha virus avlodlari va oilalari uchun veb-resurs ViralZone-ning batafsil ko‘rinishi ko‘rsatilgan. Umuman olganda, quyidagi ma’lumotlar har bir resursni tavsiflaydi:

10-rasm. Resursning batafsil ko‘rinishi (ViralZone). Ikkita kulrang qutida Operatsiyalar [1] va Mavzular, ma’lumotlar va formatlar [2] bilan bog‘liq EDAM shartlari ko‘rsatilgan. Sahifaning pastki qismida [3] Mavzu turidagi kamida bitta atamani ViralZone bilan baham ko‘radigan resurslar takliflari ro‘yxati keltirilgan.

• 
  Ism
  
• 
  Tavsif
  
• 
  Resurs turi (dasturiy ta’minot va/yoki ma’lumotlar bazasi)
  
• 
  Kategoriyalar (genlar va genomlar, genomika, metagenomika, transkriptomika, oqsillar va proteomalar, evolyutsiya va filogeniya, evolyutsiya biologiyasi, populyatsiya genetikasi, strukturaviy biologiya, dori dizayni, dori kimyosi, strukturaviy tahlil, tizimlar biologiyasi, glikomika, lipidomika va milekstomika, Mashinani o‘rganish)
  
• 
  Majburiy emas taqdimot video
  
• 
  URL
  
• 
  Resursni boshqaradigan SIB guruhi
  
• 
  Litsenziya shartlari
  
• 
  Turdagi kalit so‘zlar:
  

O‘ng oynadagi kalit so‘zni bosish ushbu kalit so‘zga mos keladigan yangi so‘rovni ishga tushiradi. Eski ExPASy-dagi kalit so‘zlar standartlashtirilmagan yoki keng tarqalgan ishlatiladigan ontologiyaga amal qilmagan (bu kalit so‘zlar maqolaning qolgan qismida “uy ichidagi kalit so‘zlar” sifatida belgilanadi). Yangi versiyada kalit so‘zlar bioinformatika va hisoblash biologiyasida yaxshi tasdiqlangan tushunchalarning keng qamrovli ontologiyasi bo‘lgan EDAM ga mos keladi. Resurslarni qidirish, turkumlashtirish va avtomatik ishlov berishda EDAMning qo‘llanilishi eSysbio (https://nels.bioinfo.no/), Bio-jETI va EMBOSS ilovalarida tasdiqlangan bo‘lib, uning resurs kataloglari bilan aloqadorligini ko‘rsatadi. Ontologiya mutaxassislar jamoasi tomonidan faol ishlab chiqiladi, qo‘llab-quvvatlanadi va qo‘llab-quvvatlanadi. EDAM ning to‘rtta kichik ontologiyasi qo‘llaniladi: Operatsiya, Mavzu, Ma’lumotlar va Format. EDAMda «Operatsiya» - «Kirishlar to‘plamini qayta ishlaydigan va natijalar to‘plamini keltirib chiqaradigan funktsiya». Shunday qilib, «Operatsiya» turidagi barcha EDAM shartlari «Ushbu resurs bilan nima qila olasiz?» qatorida ko‘rsatiladi. Ushbu oynadagi EDAM shartlaridan birini bosish orqali foydalanuvchi bir xil vazifani bajaradigan barcha resurslarni olishi mumkin.«Mavzu», «Ma’lumotlar»va «Format» mos ravishda dastur domenini, ma’lumot turini va manba tomonidan foydalaniladigan yoki chiqadigan ma’lumotlar formatini belgilaydi. Ushbu shartlar «Expasy-da ushbu kalit so‘zlarni ko‘rib chiqing» oynasida ko‘rsatilgan. «Mavzu» turidagi kamida bitta EDAM atamasini baham ko‘radigan resurslar ro‘yxati foydalanuvchiga SIB resurslarini o‘rganish imkonini beruvchi «Sizni ham qiziqtirishi mumkin» bo‘limida ko‘rsatilgan.