Mavzu: Oqsillarni identifikatsiyalash resursi (Protein Indentification Resource, pir). Reja: I kirish II asosiy qism

Kurs ishining maqsad va vazifalari.
Oqsillarni identifikatsiyalash resursi mavzusini o’rganish hama mutatsion kasalliklarning oldini olish chora tadbirlarini rivojlantirishdan iborat.
Kurs ishining tuzilishi:Kurs ishi kirish ,asosiy qism, xulosa 3 ta rasm, foydalanilgan adabiyotlar ro’yxati, Jami 31 betdan iborat


II Asosiy qism

1. 
   Aminokislota tarkibini aniqlash
   

Oqsillarni ketma-ketligi ni aniqlashning amaliy jarayoni aminokislotalar ketma-ketligi a yoki qisman oqsil yoki peptid. Bu oqsilni aniqlashga yoki uning xarakteristikasiga xizmat qilishi mumkin tarjimadan keyingi modifikatsiyalar. Odatda, oqsilning qisman ketma-ketligi, uni kontseptual asoslardan kelib chiqqan oqsillar ketma-ketligining ma'lumotlar bazalariga asoslanib aniqlash uchun etarli ma'lumot (bir yoki bir nechta ketma-ketlik yorliqlari) beradi. tarjima ning genlar.
P
roteinlarni ketma-ketlikning ikkita asosiy to'g'ridan-to'g'ri usullari mass-spektrometriya va Edman degradatsiyasi yordamida oqsil sekvenatori (sekvensiya). Ommaviy spektrometriya usullari hozirgi kunda oqsillarni ketma-ketligi va identifikatsiyasi uchun eng keng qo'llaniladi, ammo
Bekman-Spinko oqsil-peptid sekvensiyasidan foydalanish, 1970 y
Edman degradatsiyasi oqsillarni tavsiflash uchun qimmatli vosita bo'lib qolmoqda N-terminus.
Aminokislota tarkibini aniqlash
 Odatda buyurtma qilingan ketma-ketlikni topishga urinishdan oldin oqsilning tartibsiz aminokislota tarkibini bilish maqsadga muvofiqdir, chunki bu bilimlar ketma-ketlikdagi xatolarni aniqlashni osonlashtirish yoki noaniq natijalarni farqlash uchun ishlatilishi mumkin. Ayrim aminokislotalarning chastotasi haqidagi bilimlardan qaysi birini tanlash uchun foydalanish mumkin proteaz oqsilni hazm qilish uchun ishlatish. Past darajadagi nostandart aminokislotalarning (masalan, norleusin) oqsillarga noto'g'ri qo'shilishi ham aniqlanishi mumkin.^[1] Odatda deb ataladigan umumlashtirilgan usul aminokislotalar tahlili^[2] aminokislotalar chastotasini aniqlash uchun quyidagilar:

1. 
   Ma'lum miqdordagi oqsilni tarkibiga kiruvchi aminokislotalarga gidroliz qiling.
   
2. 
   Aminokislotalarni qandaydir tarzda ajratib oling va miqdorini aniqlang.
   

Gidroliz
Gidroliz oqsil namunasini 6 M da qizdirish orqali amalga oshiriladi xlorid kislota 24 soat yoki undan ko'proq vaqt davomida 100-110 ° S gacha. Ko'p miqdordagi oqsillar hidrofob guruhlar uzoqroq isitish davrlarini talab qilishi mumkin. Ammo, bu holatlar shunchalik kuchliki, ba'zi aminokislotalar (serin, treonin, tirozin, triptofan, glutaminva sistein) tanazzulga uchragan. Biokimyo Onlayn ushbu muammoni chetlab o'tish uchun har xil vaqt uchun alohida namunalarni isitishni, har bir olingan eritmani tahlil qilishni va gidrolizning nolga teng vaqtiga ekstrapolyatsiyani taklif qiladi. Rastall degradatsiyani oldini olish yoki kamaytirish uchun turli xil reagentlarni taklif qiladi, masalan tiol reaktivlar yoki fenol triptofan va tirozinni xlor va oksidlanishdan oldin sistein ta'siridan himoya qilish. U shuningdek miqdorini o'lchashni taklif qiladi ammiak darajasini aniqlash uchun rivojlandi amid gidrolizi.