Microsoft Word 60 2012 Белясова doc
Download 5.01 Kb. Pdf ko'rish
|
belyasova molekulyarnaya biotexnologiya
Репарация ДНК. Несмотря на высокую точность работы фермен-
тов, осуществляющих репликацию ДНК, а также на существование ме- ханизма корректорской правки, при синтезе новых цепей ДНК все же происходят ошибки, связанные с включением в их состав некомпле- ментарных нуклеотидов. Кроме того, молекулы ДНК подвергаются в клетках воздействию разнообразных физических и химических факто- ров, нарушающих их структуру. К числу наиболее часто возникающих повреждений ДНК можно отнести следующие: – разрыв β-N-гликозидных связей между пурином и дезоксирибо- зой (депуринизация), который чаще всего является следствием по- вышения температуры. За сутки в клетке человека совершается от 5000 до 10 000 актов депуринизации; – спонтанное дезаминирование остатков цитозина и аденина с об- разованием соответственно остатков урацила и гипоксантина (при- мерно 100 событий на геном в сутки); 42 – алкилирование азотистых оснований под действием химических веществ особого класса (алкилирующих агентов); – интеркаляцию (встраивание) некоторых соединений между со- седними парами нуклеотидов; – образование ковалентных сшивок между цепями ДНК под дей- ствием бифункциональных агентов; – образование при поглощении ультрафиолетового света (УФ) циклобутановых димеров (рис. 1.14) между соседними пиримидинами в цепи. Большинство перечисленных повреждений нарушают процессы репликации и экспрессии генов, например каждый тиминовый димер в ДНК E. coli задерживает репликацию на 10 с. Кроме того, эти по- вреждения являются источником мутаций, если их исправление не осуществится до начала репликации ДНК. Чаще всего подобные нарушения происходят лишь в одной из ни- тей ДНК, при этом во второй нити напротив повреждения в большин- стве случаев содержится «правильная» последовательность, которая может служить матрицей для исправления ошибок. Таким образом, двойная спираль ДНК, а также то, что в ней закодирована информация о структуре репарационных ферментов, делают возможным уникаль- ный механизм исправления ошибок (репарацию), характерный только для одного класса молекул – ДНК. Репарационных систем и механизмов, существующих у разных организмов, очень много; среди них есть такие, которые специфичны для исправления повреждений лишь одного рода, а есть и менее спе- цифичные. Для удобства все известные к настоящему времени репарацион- ные процессы можно разделить на две категории: 1) те, что не требуют участия репликации и представляют собой непосредственное исправление нарушений в ДНК; 2) более сложные процессы, в ходе которых происходит репара- ционная репликация. Лучше всего репарационные механизмы изучены по отношению к исправлению повреждений, вызванных УФ-облучением, – пиримиди- новых димеров (рис. 1.14). Поскольку в наиболее известных процессах репарации послед- ствий УФ-облучения принимают участие зависимые от УФ-света фер- менты, репарационные механизмы делят также на световую (способ- ную осуществиться лишь на видимом свету) и темновую (не требую- щую участия видимого света) репарацию. 43 CH 3 O N N R CH 3 O N N N N R O CH 3 УФ O O O H H H H O N N O CH 3 R R Рис. 1.14. Образование тиминовых димеров в одной из цепей ДНК, включающее формирование циклобутанового кольца (состоит из четырех углеродных атомов) при взаимодействии атомов соседних пиримидиновых оснований К репарационным механизмам прямого исправления повреждений можно отнести дезалкилирование остатков гуанина и мономеризацию циклобутановых димеров между соседними пиримидиновыми основа- ниями. Дезалкилирование метилгуаниновых остатков относится к тем- новой репарации и происходит при участии ферментов, присутствую- щих в клетках бактерий и млекопитающих. При этом О 6 -метилгуанин- ДНК-алкилтрансфераза катализирует перенос алкильных групп на сульфгидрильные группы цистеиновых остатков фермента (рис. 1.15). Рис. 1.15. Дезалкилирование О 6 -метилгуаниновых остатков, которое катализируется специфической ДНК-алкилтрансферазой – O – O O P O H 2 C H O O – O O P O N N N N OC H 3 NH 2 + Фермент–SH NH 2 N N N N O P O O – O O H H 2 C O P O O – O – О + Фермент–SH–CH 3 H 44 Расщепление димеров между пиримидиновыми нуклеотидами происходит в процессе фотореактивации – восстановления структу- ры молекул ДНК, поврежденных УФ-излучением, в результате после- дующего воздействия видимого света (световая репарация). Известна неферментативная коротковолновая фотореактивация, которая заклю- чается в мономеризации димеров при действии ультрафиолетового излучения с длиной волны 240 нм, а также ферментативная фотореак- тивация. Последнюю обычно и подразумевают под собственно фото- реактивацией. Этот процесс требует участия видимого света с длиной волны 300–600 нм и осуществляется под действием специфических фотореактивирующих ферментов (дезоксирибопиримидинфотолиазы). Субстратом фотолиазы служат димеры пиримидиновых оснований, с которыми она образует комплекс (с неповрежденной ДНК фермент не связывается). Используя энергию поглощенного света, фермент раз- рушает димер без разрыва цепей ДНК (рис. 1.16). Рис. 1.16. Образование тиминовых димеров под действием УФ-облучения и их разрушение на свету при помощи фотореактивирующего фермента Явление фотореактивации широко распространено в природе и обнаружено даже у таких примитивных микроорганизмов, как мико- плазмы. Фотореактивирующие ферменты найдены у некоторых выс- ших растений и животных, а также у всех изученных бактерий, за ис- ключением Deinococcus radiodurans, которые тем не менее чрезвы- чайно устойчивы к действию УФ-света: эти бактерии выдерживают дозы в 1000 раз более высокие, чем те, которые убивают E. coli. При полном отсутствии способности к фотореактивации D. radiodurans обладает мощной системой эксцизионной репарации. Репарационные события, связанные с заменой искаженных участ- ков, не требуют участия видимого света, и в них, кроме других фермен- тов, важную роль играют нуклеазы двух типов – экзо- и эндонуклеазы. Экзонуклеазы осуществляют расщепление ДНК, начиная с концов це- пей, а эндонуклеазы атакуют цепи во внутренних частях, формируя в ДНК однонитевые разрывы. Среди многообразия видов репарации, свя- занной с репаративным синтезом ДНК, можно выделить два основных – Download 5.01 Kb. Do'stlaringiz bilan baham: |
Ma'lumotlar bazasi mualliflik huquqi bilan himoyalangan ©fayllar.org 2024
ma'muriyatiga murojaat qiling
ma'muriyatiga murojaat qiling