Vazirligi urganch davlat universiteti tabiiy fanlar fakulteti " biologiya" kafedrasi "tasdiqlandi"


Download 0.68 Mb.
Pdf ko'rish
bet10/14
Sana06.04.2023
Hajmi0.68 Mb.
#1332500
1   ...   6   7   8   9   10   11   12   13   14
Bog'liq
bioinformatik - 3 kurs yangi

2- topshiriq 
1. Quyidagi berilgan organizmning genomi nechta nukleotiddan iborat 
(Geochelone elephantopus) 
2.
Quyidagi berilgan organizmning genomidagi 2221 va 2701 nukleotidni 
aniqlang ( Cygnus olor)
3. Quyidagi berilgan organizmning genomidagi 8881, 15901 va 15960 
nukleotidni aniqlang ( bubo bubo) 




Amaliy mashg‟ulot-3 
Blast dasturi vositasida aminokislotalar ketma-ketliklarini taqqoslash
 
1-topshiriq 
 
1.Ushbu ketma-ketlik asosida oqsilni identifikatsiya qiling. Blast dasturi 
yordamida turni aniqlang 
NP_001035835.1 
2. Ushbu ketma-ketlik asosida oqsilni identifikatsiya qiling. Blast dasturi 
yordamida turni aniqlang 
XP_014388588.1 
3.
Ushbu ketma-ketlik asosida oqsilni identifikatsiya qiling. Blast dasturi 
yordamida turni aniqlang 
NP_990849.1 
4. Ushbu ketma-ketlik asosida oqsilni identifikatsiya qiling. Blast dasturi 
yordamida turni aniqlang 
NP_001303327.1 
5. Ushbu ketma-ketlik asosida oqsilni identifikatsiya qiling. Blast dasturi 
yordamida turni aniqlang 
CAA59235.1 
6.
Ushbu ketma-ketlik asosida oqsilni identifikatsiya qiling. Blast dasturi 
yordamida turni aniqlang
LAKYMVKRDTENVNDKLRGILLNKKEAFSYLTKREASGSITCECCFNQCRIFELAQYCRLPDHFFSRISR 
TGRSNSGHAQLEDNFS 


7. Ushbu ketma-ketlik asosida oqsilni identifikatsiya qiling. Blast dasturi 
yordamida turni aniqlang
MGDLRKLALQLQQKCNEPCRDTVQIQPITGTDCQDIANKGATTSGLYYVKPAKAEGQFLVYCEIDAFGRG 
FTVIQRRRDGSVDFFKDWIQ 
8. Ushbu ketma-ketlik asosida oqsilni identifikatsiya qiling. Blast dasturi 
yordamida turni aniqlang 
SSRSVTRDHFNRQKEFVKTILGEFPLGEELTQAGIIKYGRTADIEINFGEFLTQTDLFNAID
KIKHSQADESRLDLALKKAHEELFTSQGARSDKDIEKAIVILGDGYISGGGNRSRDLIESA
KKEAAKLRELGVLIFTIGVGAEPNSLLLQNFASKKTYYITVKDYGQLIGKIGALKTSISSA
CNVVTPGEPGRDGRPGEKGLVGEKGKKGNDGISPKGLQGPKGIKGEKGSLGVGIKGLPG
DEGPVGPIGENGIPGKDGVSVDGAPGLKGARGEPGDGIKGIKGLRGKVGDVGLPGVDSK
QYYVIRFYKQTCCLLDSSGSVGDENFDKMKEFVKSIVLNFDVDNQLTRIGIIRFDSDAEIII
QLSDHKTLKDLLNDIDSIRYNEGIQTRIDKALERAMEAFSEKNGGRADATKALVLL 
9. Ushbu ketma-ketlik asosida oqsilni identifikatsiya qiling. Blast dasturi 
yordamida turni aniqlang 
GVPGAGIPQLGVQPGAKASKYGLPGVGGVPGVGGVPGVGGVPGVGGVPGVGGVPGVG
GVPGVGGVPGPTISGLGAKPPKIGGVGAGGFPAGVGVGGVPGAGAYPAGGKPPKPGYG
AGAGLIPGGGITPGAGLGAGLVPGAGTGAGLYPGGKPPKPGYGLPGGALTPGAGLQPG
AGLQPGAGLQPGAGLQPGAGLQPGAGLQPGAATGAGT 
10. Ushbu ketma-ketlik asosida oqsilni identifikatsiya qiling. Blast dasturi 
yordamida turni aniqlang 
VPTENKISQFYQKWKFLQYLQALHQGQIVMNPWDQGKTRAYPFIPTVNTEQLSISEESTE
VPTEESTEVFTKKTELTEEEKDHQKFLNKIYQYYQTFLWPEYLKTVYQYQKTMTPWNHI
KRYF 
11. Ushbu ketma-ketlik asosida oqsilni identifikatsiya qiling. Blast dasturi 
yordamida turni aniqlang 
QELICGASIISDRWVLTAAHCIFYPPWDKNYTTEDILVRIGKHYRTKYERQQEKIRMLERI
IIHPKYNWRENLDRDIALIQLKRPIGFTNYIHPVCLPTKEIVQTLMLNRHKGRVSGWGNL
HETWTSGGQALPQVLQQVN 
12. Ushbu ketma-ketlik asosida oqsilni identifikatsiya qiling. Blast dasturi 
yordamida turni aniqlang 
KKPERDEWGSGLEAMQCALQLEKNVNQALLDLHKVASDKGDPHLCDFLETHYLNEQV 
13. Ushbu ketma-ketlik asosida oqsilni identifikatsiya qiling. Blast dasturi 
yordamida turni aniqlang. 
XP_025749991.1 
14.
Ushbu ketma-ketlik asosida oqsilni identifikatsiya qiling. Blast dasturi 
yordamida turni aniqlang 
NFYIPMFNKTGVVRSPFEYPQYYLAEPWKYSVLAAYMFMLILLGLPINFMTLYVTIQHKKLRTPL
NYILLNLAFANH
FMVLCGFTITLYTSLHGYFVFGQTGCYF 

Download 0.68 Mb.

Do'stlaringiz bilan baham:
1   ...   6   7   8   9   10   11   12   13   14




Ma'lumotlar bazasi mualliflik huquqi bilan himoyalangan ©fayllar.org 2024
ma'muriyatiga murojaat qiling