Vazirligi urganch davlat universiteti tabiiy fanlar fakulteti " biologiya" kafedrasi "tasdiqlandi"


Download 0.68 Mb.
Pdf ko'rish
bet12/14
Sana06.04.2023
Hajmi0.68 Mb.
#1332500
1   ...   6   7   8   9   10   11   12   13   14
Bog'liq
bioinformatik - 3 kurs yangi

2-topshiriq 
Har bir talaba 35 ta hayvonning nukleotidlarini tanslyatsiya qiling 
1. 10 tur umurtqasiz hayvon 
2.5 tur baliq 
3. 5 tur amfibiya 
4.5 tur reptiliya 
5.5 tur qush 
6.5 tur sutemizuvchi 
 
 
 
 
 


Amaliy mashg‟ulot-5 
Oqsil molekulalarida gomologik domenlarni izlash 
Protein domeni oqsilning uchinchi darajali tuzilishining elementi bo'lib, u 
ancha barqaror va mustaqil protein substruktsiyasi bo'lib, uning yig'ilishi qolgan 
qismlardan mustaqil ravishda sodir bo'ladi. Domen odatda ikkinchi darajali 
strukturaning bir nechta elementlarini o'z ichiga oladi. Tuzilish sohalarida 
o'xshashlik nafaqat tegishli oqsillarda balki mutlaqo boshqa proteinlarda ham 
mavjud. 
1-topshiriq 
1.Ushbu ketma-ketlik asosida oqsilni identifikatsiya qiling. Blast dasturi 
yordamida ushbu tur oqsilining gomologini toping.
CAA50010.1
2. Ushbu ketma-ketlik asosida oqsilni identifikatsiya qiling. Blast dasturi 
yordamida ushbu tur oqsilining gomologini toping
CAA79145.1
3.
Ushbu ketma-ketlik asosida oqsilni identifikatsiya qiling. Blast dasturi 
yordamida ushbu oqsil gomologini toping
NP_990849.1 
4. Ushbu ketma-ketlik asosida oqsilni identifikatsiya qiling. Blast dasturi 
yordamida ushbu oqsil gomologini toping
NP_001303327.1 
5. Ushbu ketma-ketlik asosida oqsilni identifikatsiya qiling. Blast dasturi 
yordamida ushbu oqsil gomologini toping
CAA59235.1 
6.
Ushbu ketma-ketlik asosida oqsilni identifikatsiya qiling. Blast dasturi 
yordamida ushbu oqsil gomologini toping 
LAKYMVKRDTENVNDKLRGILLNKKEAFSYLTKREASGSITCECCFNQCRIFELAQYCRLPDHFFSRISR 
TGRSNSGHAQLEDNFS 
7. Ushbu ketma-ketlik asosida oqsilni identifikatsiya qiling. Blast dasturi 
yordamida ushbu oqsil gomologini toping 
MGDLRKLALQLQQKCNEPCRDTVQIQPITGTDCQDIANKGATTSGLYYVKPAKAEGQFLVYCEIDAFGRG 
FTVIQRRRDGSVDFFKDWIQ 
8. Ushbu ketma-ketlik asosida oqsilni identifikatsiya qiling. Blast dasturi 
yordamida ushbu oqsil gomologini toping
SSRSVTRDHFNRQKEFVKTILGEFPLGEELTQAGIIKYGRTADIEINFGEFLTQTDLFNAID
KIKHSQADESRLDLALKKAHEELFTSQGARSDKDIEKAIVILGDGYISGGGNRSRDLIESA
KKEAAKLRELGVLIFTIGVGAEPNSLLLQNFASKKTYYITVKDYGQLIGKIGALKTSISSA
CNVVTPGEPGRDGRPGEKGLVGEKGKKGNDGISPKGLQGPKGIKGEKGSLGVGIKGLPG
DEGPVGPIGENGIPGKDGVSVDGAPGLKGARGEPGDGIKGIKGLRGKVGDVGLPGVDSK
QYYVIRFYKQTCCLLDSSGSVGDENFDKMKEFVKSIVLNFDVDNQLTRIGIIRFDSDAEIII
QLSDHKTLKDLLNDIDSIRYNEGIQTRIDKALERAMEAFSEKNGGRADATKALVLL 
9. Ushbu ketma-ketlik asosida oqsilni identifikatsiya qiling. Blast dasturi 
yordamida ushbu oqsil gomologini toping 
GVPGAGIPQLGVQPGAKASKYGLPGVGGVPGVGGVPGVGGVPGVGGVPGVGGVPGVG
GVPGVGGVPGPTISGLGAKPPKIGGVGAGGFPAGVGVGGVPGAGAYPAGGKPPKPGYG


AGAGLIPGGGITPGAGLGAGLVPGAGTGAGLYPGGKPPKPGYGLPGGALTPGAGLQPG
AGLQPGAGLQPGAGLQPGAGLQPGAGLQPGAATGAGT 
10. Ushbu ketma-ketlik asosida oqsilni identifikatsiya qiling. Blast dasturi 
yordamida ushbu oqsil gomologini toping
VPTENKISQFYQKWKFLQYLQALHQGQIVMNPWDQGKTRAYPFIPTVNTEQLSISEESTE
VPTEESTEVFTKKTELTEEEKDHQKFLNKIYQYYQTFLWPEYLKTVYQYQKTMTPWNHI
KRYF 
11. Ushbu ketma-ketlik asosida oqsilni identifikatsiya qiling. Blast dasturi 
yordamida ushbu oqsil gomologini toping
QELICGASIISDRWVLTAAHCIFYPPWDKNYTTEDILVRIGKHYRTKYERQQEKIRMLERI
IIHPKYNWRENLDRDIALIQLKRPIGFTNYIHPVCLPTKEIVQTLMLNRHKGRVSGWGNL
HETWTSGGQALPQVLQQVN 
12. Ushbu ketma-ketlik asosida oqsilni identifikatsiya qiling. Blast dasturi 
yordamida ushbu oqsil gomologini toping
KKPERDEWGSGLEAMQCALQLEKNVNQALLDLHKVASDKGDPHLCDFLETHYLNEQV 
13.
Ushbu ketma-ketlik asosida oqsilni identifikatsiya qiling. Blast dasturi 
yordamida ushbu oqsil gomologini toping
XP_025749991.1 
14.
Ushbu ketma-ketlik asosida oqsilni identifikatsiya qiling. Blast dasturi 
yordamida ushbu oqsil gomologini toping
NFYIPMFNKTGVVRSPFEYPQYYLAEPWKYSVLAAYMFMLILLGLPINFMTLYVTIQHKKLRTPL
NYILLNLAFANHFMVLCGFTITLYTSLHGYFVFGQTGCYF 

Download 0.68 Mb.

Do'stlaringiz bilan baham:
1   ...   6   7   8   9   10   11   12   13   14




Ma'lumotlar bazasi mualliflik huquqi bilan himoyalangan ©fayllar.org 2024
ma'muriyatiga murojaat qiling