Vazirligi urganch davlat universiteti tabiiy fanlar fakulteti " biologiya" kafedrasi "tasdiqlandi"

 
 
 
2-topshiriq 
Har bir talaba 30 ta hayvonning ochiq o‟qish ramkasini aniqlang
1. 5 tur umurtqasiz hayvon 
2. 5 tur baliq 
3. 5 tur amfibiya 
4. 5 tur reptiliya 
5. 5 tur qush 
6. 5 tur sutemizuvchi 
 
 
 

---

Amaliy mashg‟ulot-7 
ORF Finder dasturida ishlash 
ORF qidiruvchisi NCBI veb-saytida mavjud bo'lgan dasturdir.ORFni tahlil 
qilish orqali tarjima jarayonida hosil bo'ladigan aminokislotalarni taxmin 
qilishimiz mumkin. Yangi ketma-ket kelgan gendan to'g'ri ORFni bashorat qilish 
muhim qadamdir. U barcha ochiq o'qish ramkalarini yoki mumkin bo'lgan 
oqsillarni kodlash hududini ketma-ketlikda aniqlaydi.
ORF Finder (Open Reading Frame Finder) foydalanuvchi ketma-ketligida 
yoki maʼlumotlar bazasida mavjud boʻlgan ketma-ketlikda tanlanadigan minimal 
oʻlchamdagi barcha ochiq oʻqish kadrlarini topadigan grafik tahlil 
vositasidir. Ushbu vosita standart yoki muqobil genetik kodlar yordamida barcha 
ochiq o'qish ramkalarini aniqlaydi. Aniqlangan aminokislotalar ketma-ketligi turli 
formatlarda saqlanishi va 
asosiy mahalliy hizalama qidiruv vositasi
(BLAST) 
serveri yordamida ketma-ketlik ma'lumotlar bazasidan izlanishi mumkin. ORF 
Finder to'liq va aniq ketma-ketliklarni tayyorlashda yordam berishi kerak. 
1-topshiriq 
Quyidagi turlar genomini ORF dasturi orqali taxlil qiling 
1.aurelia aurita 
2.clione limacine 
3.helix pomatia 
4.artemia salina 
5.buthus eupeus 
6.galeodus caspius
7.pipa pipa 
8.bufo bufo 
9.hulo arborea 
10.rana goliaph 
11.draco Volans 
12.varanus griseus 
13.chamaelon vulgaris 
14.eunetes murinus
15.naja oxiana
16. vipera lebetina 
17.caiman crocodilus
18. trionyx sinensis 
19.gavia arctica 
20.vultur gryphus 
21.falco tinnunculus 
22.aegypius monachus 
23.grus leucogieranus
24.larus ridibudus 
25.cuculus canorus