Vazirligi urganch davlat universiteti tabiiy fanlar fakulteti " biologiya" kafedrasi "tasdiqlandi"
Download 0.68 Mb. Pdf ko'rish
|
bioinformatik - 3 kurs yangi
2-topshiriq
Ushbu odam oqsillarining gomologik domenlarini taxlil qiling. Odam oqsillari bilan o‟xshashlik darajasini (%) aniqlang 1.gemoglabin 2.ximotripsin 3.formin 4.koronin 5.mutein 2-topshiriq Har bir talaba 25 ta hayvonning oqsillarining gomologik domenlarini taxlil qiling 1. 5 tur umurtqasiz hayvon 2.5 tur baliq 3.5 tur reptiliya 4.5 tur qush 5.5 tur sutemizuvchi Amaliy mashg‟ulot-6 Hisoblashning ochiq ramkasini izlash Qabul qilish kodonidan boshlanib, to'xtash kodoni bilan tugaydigan nukleotidning maydoni ochiq o'qish ramkasi (ORF) deb ataladi. Proteinlar ORFdan hosil bo'ladi. ORFni tahlil qilish orqali biz tarjima paytida hosil bo'lishi mumkin bo'lgan aminokislotalarni taxmin qilishimiz mumkin. Molekulyar biologiyada ochiq o'qish ramkalari ( ORF ) boshlang'ich va to'xtash kodonlari orasidagi DNK ketma - ketligi oralig'i sifatida aniqlanadi. Boshlang'ich kodoni (birinchi bo'lishi shart emas) tarjima qayerdan boshlanishi mumkinligini ko'rsatadi. Transkripsiyani tugatish joyi ORF dan keyin, tarjimani to'xtatish kodonidan tashqarida joylashgan. Agar transkripsiya to'xtash kodonidan oldin to'xtasa, tarjima paytida to'liq bo'lmagan oqsil hosil bo'ladi. Ko'p ekzonli eukaryotik genlarda intronlar olib tashlanadi va ekzonlar transkripsiyadan so'ng birlashtirilib, oqsil translatsiyasi uchun yakuniy mRNK hosil bo'ladi . Genlarni topish kontekstida ORF ning start-stop ta'rifi genomik DNK emas, balki faqat birlashtirilgan mRNKlar uchun amal qiladi, chunki intronlar to'xtash kodonlarini o'z ichiga olishi va/yoki o'qish ramkalari o'rtasida siljishlarni keltirib chiqarishi mumkin. Ma‟lum bir genning kodlovchi qismida bir nechta mutatsiyalar (A, B, C, D) aniqlandi. 2.1. Ushbu ketma – ketlikdagi kodlarni (Wt, A, B, C, D) bitta harfli aminokislota kodlariga tarjima qiling. Genetik kod jadvalidan foydalaning! 2.Legionella shtammlarini (legioner kasalligini qo„zg„atuvchi bakteriya) flaA gen alleli yordamida aniqlash mumkin. Bu gen bacterium‟s flagellum xivchinining bir qismi bo„lgan oqsilni kodlaydi. Quyida Legionella flaA genining DNK kodlovchi zanjiridagi (matritsaga komplementar zanjir) 670 dan 700 gacha bo„lgan nukleotidlari (azot asoslari) keltirilgan. 197dan 199gacha bo‟lgan azot asoslari start kodon hisoblanadi. a) Bakteriyaning flaA geni asosida sintezlangan oqsildagi jami aminokislota sonini aniqlang. b) Bakteriyadagi flaA genining yuqorida keltirilgan fragmenti asosida sintezlangan oqsildagi aminokislotalar ketma-ketligi yozing. Genetik kod jadvalidan foydalaning. 3.Berilgan DNK ketma-ketligiga asoslanib, ochiq o'qish ramkasi berilgan qatorni aniqlang. Aminokislotalar ketma-ketligi yozing. Genetik kod jadvalidan foydalaning Download 0.68 Mb. Do'stlaringiz bilan baham: |
Ma'lumotlar bazasi mualliflik huquqi bilan himoyalangan ©fayllar.org 2024
ma'muriyatiga murojaat qiling
ma'muriyatiga murojaat qiling