Guruh talabasi Gulsanam Toshaliyevaning Bioorganika fanidan Mavzu

3. Proteomikaning klinik jihatlari
Proteomikaning klinik jihatlari eng murakkablardan biri bo'lib, zamonaviy darajadagi bios namunalaridagi proteomning dekodlanishi bitta tsiklda biosambldagi barcha oqsillarni ajratish va keyinchalik identifikatsiyalash va tahlil qilish imkonini beradigan usullar bilan amalga oshiriladi. Ushbu usullarga xromatografik, elektroforetik va mass-spektrometrik texnologiyalarning turli xil modifikatsiyalari kiradi (3-bobga qarang). Klinik proteomikada 25 ta usuldan foydalangan holda, ularning mavjudligi ma'lum patologiyalar bilan bog'liq bo'lgan oqsillarni topadi.Bunday oqsillar tegishli kasalliklarning markerlari rolini o'ynaydi. Kasallik belgilarini, xususan o'simta belgilarini aniqlash molekulyar diagnostika asoslaridan biridir. Masalan, oqsil timozin beta-15 turli xil xavfli o'smalar siydigida uchraydi. Shubhasiz, bu protein hujayraning malign transformatsiyasining molekulyar mexanizmlarida ishtirok etadi. Shunga ko'ra, run-15 timosin geni va uning ekspression mahsulotlari nafaqat diagnostik belgilar, balki o'smaning o'sishini to'xtatish uchun dori vositalariga ham aylanishi mumkin. Boshqa bir marker sifatida Prostata Stem Hujayra prostata ildiz hujayralarining antigenini nomlash mumkin. Prostata saratoni va uning metastazlarida PSCA genining antigen (PSCA) haddan tashqari ekspressioni (80% gacha) aniqlandi. Proteomikaning muhim bo'limi oqsil almashinuviga dorivor ta'sirini o'rganishdir. Oqsillarning o'zgarishi va bu holda kuzatilgan patologiyalar o'rtasidagi belgilangan o'zaro bog'liqlik asosida terapevtik ta'siri oqsil almashinuviga ta'siri bilan belgilanadigan ko'plab dorilar ishlab chiqilgan. Bunday dorilar farmatsevtika bozoridagi barcha dorilarning 90% dan ko'prog'ini tashkil qiladi. Ko'p sonli tadqiqotlar natijasida 20D usullarining ma'lumotlari oqsillarning ishlash mexanizmlari bilan o'zaro bog'liqligi ko'rsatildi. Masalan. agar preparat peroksizomalarda ko'payishni kuchaytirsa, elektroforetrammada ushbu peroksizomalar tarkibidagi oqsillarning ko'payishi kuzatiladi. Shunday qilib, dorivor maqsadlar oqsillarini ilentifikatsiyasi tinch tinch oqsillarning ishlash mexanizmlarini yaratishga imkon beradi. 2D da. Qonda xolesterin miqdorini pasaytiradigan lovastatinning farmakodinamikasini o'rganayotganda, qon plazmasiga lovastatin yuborilishi HMG-koenzim A sintaz oqsili miqdorini sezilarli darajada oshirib, boshqa oqsillarni kamaytirishi aniqlandi. Ushbu ma'lumotlarga asoslanib, oqsilning ta'sir mexanizmi ekanligi ko'rsatildi oqsil, lovastatin - bu lipoprotein retseptorlari faolligini oshirish, bu esa xolesterolni tojdan olib tashlaydi. Ko'rib chiqilgan ma'lumotlar shuni ko'rsatadiki, to'qimalarda gen ekspressioni juda moslashuvchan, ko'p sonli omillar ta'siriga javob beradi va deyarli har doim bir yoki ikkita emas, balki ko'plab genlarni o'z ichiga oladi. 2D elektroforez bunday dinamik o'zgarishlarni o'rganish uchun juda mos keladi. Zamonaviy proteomik tadqiqotlar turli xil texnik usullarni takomillashtirishga va ma'lumotlar bazasini doimiy ravishda silliqlashga qaratilgan. Bu bizga proteomik tadqiqotlardagi yutuqlar bir vaqtda olib boriladigan klinik biokimyo salohiyatini sifat jihatidan yaxshilaydi deb umid qilishimizga imkon beradi. Proteomikaning umumiy vazifasi hujayralarda sintez qilingan barcha oqsillarni aniqlash, shuningdek oqsil molekulalarining tuzilishini, ularning miqdorini, lokalizatsiyasini, modifikatsiyasini va o'zaro ta'sir mexanizmlarini aniqlashdan iborat. Miss Spectromics kasalliklari bemorlarning protennogrammasini normadagi protennogramma bilan taqqoslash orqali aniqlanadi. Patologiyalarning prognozlari me'yordan sezilarli darajada farq qiladi, ba'zi oqsillarning ortiqcha miqdorini va boshqalarning etishmasligini ko'rsatadi.

Klinik protoomikada asosiy xususiyatlar identifikatsiya qilish, sinov namunasidagi barcha individual oqsillarni miqdoriy aniqlash (qon zardobi, miya omurilik suyuqligi, siydik, biopsiya) va oqsil kontsentratsiyasining o'zgarishini kuzatish (kuzatish).

Har xil biologik namunalar - hujayralar, to'qimalar, organlar va biologik barcha oqsillarni tahlil qilish ikki o'lchovli elektroforez yordamida individual oqsillarni keyinchalik mass-spektrometrik identifikatsiyalash bilan amalga oshiriladi, bu bitta biologik namunada 10000 tagacha individual oqsillarni tahlil qilishga imkon beradi.



Albumin Alpha "Veta 4.13-rasm. Plazmadagi oqsillarning massa spektrlari (proteinogrammalar, massa-barmoq izlari) qonni normada kamaytirdi (egri 1) va patologiyalarda (egri chiziqlar 2): a-miyeloma - alfa- (a. A) va beta darajasi -globulinlar (Bb. B3), gamma-globudin darajasining oshishi; b- alfa- (a, ") va beta-globulinlarning (B) pasayishi, peritonit uropen beta- (B") va gamma-globulinlar; b-gepatit - alfa, beta va gamma globulinlari darajasining ko'tarilishi
Turli xil bioassaylar protseduralar ketma-ketligini o'z ichiga oladi. Bunga quyidagilar kiradi: analitik protseduralar uchun bioassayni tanlash va tayyorlash 3. ikki o'lchovli elektroforez va jeldagi oqsil dog'larining namoyon bo'lishi: suyuqliklar. dog'lar sonini va ularning elektroenergetika sxemasi bo'yicha joylashishini aniqlash; individual oqsil dog'larini o'z ichiga olgan jelning maydonlarini ajratib ko'rsatish; jeldagi alohida oqsillarni tripin bilan peptid bo'laklariga ajratish; peptidlarning mass-spektrometrik tahlili (ommaviy barmoq izlari); individual oqsillarning peptid qismlarini ketma-ketligi: tahlil natijalarini kompyuterda qayta ishlash orqali proteomni aniqlash. Ushbu texnikadan foydalangan holda yangi protein markerlari topildi. Xususan, yurak-qon tomir proteomikasi va onkoproteomika sohasida molekulyar diagnostikaning yangi usullari ishlab chiqildi. Protein metabolizmi aminokislotalar, oqsil molekulalarining eng kichik individual birliklari metabolizmi bilan chambarchas bog'liq (2-bobga qarang). Tabiiyki, oqsil metabolizmining buzilishi bilan bog'liq turli xil patologiyalar, turli jihatlarga, aminokislotalar almashinuvining buzilishidan kelib chiqadi.