I turdagi restriksion fermentlar:
Ushbu restriktaza fermentlari tanib olish joyini taniydi, lekin DNKni 400 ta asosiy juftlik (bp) dan 10 000 bp yoki 10 kbp o'ngga yoki chapga ajratadi. Bo'linish joyi aniq emas. Ushbu fermentlar ko'p funksiyali uchta peptiddan iborat. Bu fermentlar DNKning parchalanishi yoki fermentativ gidrolizi uchun Mg++, ATP va S adenozil metioninni talab qiladi. Ushbu fermentlar genetik muhandislik uchun foydali vositalar sifatida emas, balki umumiy qiziqish uchun o'rganiladi.
II turdagi restriksion fermentlar:
restriksiya va modifikasiya alohida fermentlar tomonidan amalga oshiriladi, shuning uchun modifikatsiya bo'lmaganda DNKni parchalash mumkin. Ikkala ferment bir xil maqsadli ketma-ketlikni tanisa ham, ularni bir-biridan alohida ishlashi mumkin.
Nukleotidlar ketma-ketligining bo'linishi restriksiya joyida sodir bo'ladi.Bu fermentlar aylanma simmetrik ketma-ketlikni tanib olish uchun ishlatiladi, bu ko'pincha palindromik ketma-ketlik deb ataladi.Bu palindromik bog‘lanish joyi uzilishi mumkin (masalan, BstEII 5´-GGTNACC-3´ ketma-ketligini taniydi, bu yerda N har qanday nukleotid bo‘lishi mumkin) yoki uzluksiz (masalan, KpnI 5´-GGTACC-3´ ketma-ketligini taniydi).Ular kofaktor sifatida faqat Mg2+ talab qiladi va ularning faoliyati uchun ATF kerak emas.II turdagi endonukleazalar DNKni in vitro xaritalash va rekonstruksiya qilish uchun keng qo'llaniladi, chunki ular ma'lum joylarni taniydilar va aynan shu joylarda bo'linadi.
III turdagi restriksion fermentlar:
Bu fermentlar bir xil DNK ketma-ketligini taniydi va metillaydi, lekin 24-26 bp masofada ajralib chiqadi.Ular ikki xil bo'linmaga ega bo'lib, ularda bir bo'linma (M) DNK ketma-ketligini tanib olish va o'zgartirish uchun mas'ul, boshqa sub birlik (R) esa nukleaza ta'siriga ega.Mg+2 ionlari, ATP DNKning parchalanishi uchun zarur va parchalanish jarayoni SAM (S-adenosyl methionine) tomonidan rag'batlantiriladi. Faqat bitta zanjirni kesib oladi. DNK dupleksini buzish uchun qarama-qarshi yo'nalishdagi ikkita tanib olish joyi kerak.
Do'stlaringiz bilan baham: |