5-маъруза Мавзу: Ферментларни таъсир этувчи механизмлари

Хроматографик

Хроматографик таҳлиллар хроматография ёрдамида реакция аралашмасини унинг таркибий қисмларига ажратиш орқали маҳсулот ҳосил бўлишини ўлчайди. Бу одатда юқори самарали суюқлик хроматографияси (ЮССХ) орқали амалга оширилади, лекин у нозик қатламли хроматографиянинг оддий усулидан ҳам фойдаланиши мумкин. Протоколларни ЮССХ асбобларидан бир неча баравар юқори насос босимида ишлайдиган такомиллаштирилган хроматографик асбобларга (масалан, ултра юқори босимли суюқлик хроматографияси) алмаштириш орқали ҳам таҳлил сезгирлиги оширилади

https://www.creative-enzymes.com/resource/enzyme-assays_27.html

Ферментларни таъсир этувчи механизмлари

Фермент реакциянинг активлик энергиясини камайтириб реакциянинг тезлигини оширади.

Фермент–субстрат комплексининг шаклланиши:

- қулф-калит модели

- индуцирланган тўғри келиш модели

ҚУЛФ-КАЛИТ МОДЕЛИ (СПЕЦИФИКЛИК МЕХАНИЗМИ)

• 1. Фишер назарияси 1894 йил (“қаттиқ матрица" “қулф-калит” модели – ферментнинг фаол маркази субстратнинг конфигурациясига қатъий мос келади ва у билан бирикганда ўзгармайди. Ушбу модел фермент ва субстратнинг мутлоқ спецификлигини тушунтуради.

Фишер назариясининг схемаси

Қулф-калит модели

Ушбу назария фермент таъсири қуйидагича хусусиятларга эга:

- Фаол сайт қаттиқ шаклга эга

- Фақат мос келадиган шаклга эга субстратлар рекцияга кириша олади

- субстрат-фаол сайтнинг қулфига мос калитдир

Бу эскирган модел ҳисобланиб барча ферментлар учун ишламайди

Индуцирланган тўғри келиш модели

• 2. Кошланд назарияси 1958 йил - модели ("Индуцирланган тўғри келиш модели", “қўл-қўлқоп") – фаол марказнинг мослашувчанлигини англатади. Субстрат ферментнинг занжир қисмига бирикиши каталитик марказ конфигурациясини ўзгаришига олиб келади, шунда фаол марказнинг шакли субстрат шаклига мос келади.

Кошланд назарияси схемаси

Индуцирланган тўғри келиш модели

Ферментнинг таъсиридан келиб чиқиб, уйғунлашувчи модел ҳисобланади. Қуйидаги хусусиятлар хос:

- Ферментнинг фаол қисми қаттиқ эмас, шу сабабли мослашувчан

- Фермент шакли, фаол участка ва субстрат максимал даражада мослашади, бу эса катализни яхшилайди

- субстратнинг ўзига хослиги муҳим (спецификлик)

Кўпчилик ферментларнинг таъсир қилиш усули ушбу моделга хос

Adapted from Kastritis, P., Bonvin, A., 2013a. On the binding affinity of macromolecular interactions: Daring to ask why proteins interact. J R Soc Interface 10, 20120835. doi:10.1098/rsif.2012.0835.