Proteinlar peptid bog'i bilan zanjirda bog'langan alfa-aminokislotalardan tashkil topgan yuqori molekulyar organik moddalar

1.3.2 Ikkilamchi tuzilma

Oqsilning ikkilamchi tuzilishi peptid magistralini tashkil etuvchi funktsional guruhlarning o'zaro ta'siri natijasida hosil bo'lgan fazoviy strukturadir. Bunday holda, peptid zanjirlari ikki turdagi muntazam tuzilmalarni olishi mumkin: a-spirallar (4-rasm) va b-tuzilmalar (5-rasm).
A-spiral deganda karbonil guruhlari kislorod atomlari va aminokislotalarning azot atomlari o'rtasida vodorod aloqalari hosil bo'lishi natijasida peptid magistralining spiral shaklida buralib ketishi tushuniladi. 4 ta aminokislota qoldig'i orqali peptid guruhlari.
a-spiral peptid magistralining eng barqaror konformatsiyasi bo'lib, bu a-spiralni "siquvchi" ko'plab vodorod aloqalarining mavjudligi bilan bog'liq.
b-tuzilmasi ostida buklangan "akkordeon" varag'iga o'xshash raqam tushuniladi. Shakl bitta polipeptid zanjirining chiziqli mintaqalarining peptid guruhlari atomlari o'rtasida yoki turli polipeptid guruhlari o'rtasida ko'plab vodorod aloqalarining shakllanishi natijasida hosil bo'ladi. a-spirallardan farqli o'laroq, b-tuzilmalarni tashkil etuvchi vodorod aloqalarining yorilishi polipeptid zanjirlarining bu bo'limlarining cho'zilishiga olib kelmaydi.


Guruch. 4. a-spiral



Guruch. 5. b-plisili qatlam

8. 1.3.3 Uchlamchi tuzilish

Oqsilning uchinchi darajali tuzilishi - aminokislotalar radikallari orasidagi o'zaro ta'sir natijasida hosil bo'lgan uch o'lchovli fazoviy struktura bo'lib, ular polipeptid zanjirida bir-biridan sezilarli masofada joylashgan bo'lishi mumkin (6-rasm).
Strukturaviy jihatdan u har xil turdagi o'zaro ta'sirlar bilan barqarorlashtirilgan ikkilamchi struktura elementlaridan iborat bo'lib, ularda hidrofobik o'zaro ta'sirlar muhim rol o'ynaydi.


Guruch. 6. Oqsilning uchinchi darajali tuzilishi.

Atrofdagi suv molekulalari bilan o'zaro ta'sirlashganda, oqsil molekulasi aminokislotalarning qutb bo'lmagan yon guruhlari suvli eritmadan ajratilishi uchun burishishga "indiriladi"; molekula yuzasida qutbli gidrofil yon guruhlar paydo bo'ladi.

2.