Pharmaceutical Microbiology Manual

F
OOD AND 
D
RUG 
A
DMINISTRATION
 
O
FFICE OF 
R
EGULATORY 
A
FFAIRS
 
Office of Regulatory Science
 
Document Number: 
ORA.007 
Revision #: 02 
Revised: 
25 Aug 2020 
Title:
Pharmaceutical Microbiology Manual 
Page 74 of 92
For the most current and official copy, check QMiS. 
colonies (microaerophilic); medium not inoculated. Review 
disinfection process to assess the potential of antimicrobial residue 
being introduced during sample preparation; Review gas used for 
Isolator sterilization with medium inside chamber to assess the 
potential penetration into liquid broth and/or test product packaging. 
4. Bioburden - Review the products bioburden for the presence of 
fastidious microorganisms which may require inclusion of special 
additives in the medium, such as halophilic contaminants in 
bicarbonate or high salt products need medium supplements with 
essential salts for survival. Where appropriate, the laboratory 
extend incubation time to improve the detection and recovery of 
fastidious microorganisms as part of their environmental monitoring 
program or part of investigation.
5. Water test method- Evaluate the length of storage and storage 
temperature for collected samples prior to testing. Evaluate the type 
of collection bottles and their compatibility with the testing, for 
example endotoxin testing. 
6. Adherence to methods - Review data for adequacy of incubation 
time (for example 14 days for USP <71>), temperature (USP 
required temperatures) or appropriate media usage. 
7. Worksheets - Review possible falsification or incorrect entry onto 
worksheets or Laboratory LIM system. 
Compare LIMs database entries to the analyst’s laboratory 
notebook; Phrase the question “When you get a positive test 
result….” not “If you get a positive test result...” Inspect the 
laboratory refrigerator or freezer for evidence of stored sample 
isolates. If they lyophilize sample isolates, ask to review the spread 
sheet data storage directly from the computer screen; hard copies 
could be obtained later. Review the Vitek or Micro Id isolate log book 
for all microorganisms identified and work backwards to the product 
lot number, filling rooms, equipment used, components or raw 
material used for that lot. This may allow you to find other lots 
associated with the contaminated lot. 
8. Personnel- review training records, personnel qualifications and 
experience. Observe analysts during sample collection, preparation, 
etc., and look for errors which may inhibit microbial recovery. 
9. Laboratory - Visit the microbiology laboratory and look in the 
refrigerators, incubators, look at discarded plates from that day’s 
work or request speciation log book and determine if microbial 

---