Pharmaceutical Microbiology Manual

F
OOD AND 
D
RUG 
A
DMINISTRATION
 
O
FFICE OF 
R
EGULATORY 
A
FFAIRS
 
Office of Regulatory Science
 
Document Number: 
ORA.007 
Revision #: 02 
Revised: 
25 Aug 2020 
Title:
Pharmaceutical Microbiology Manual 
Page 72 of 92
For the most current and official copy, check QMiS. 
B. Microbiological Issues for Inspection of Pharmaceutical Manufacturing 
Facilities 
The following topics should be reviewed and evaluated by a microbiologist 
although some aspects will also be covered by the Consumer Safety Officer 
during the inspection. 
1. Product sterilization or bioburden reduction stage and validation- 
aseptic/filtration, steam, ETO, radiation, and other chemical 
processes 
2. Depyrogenation- dry heat ovens for glass containers, wash/rinse for 
stoppers, adequacy of validation using spiked endotoxin, recovery 
studies before depryrogenation, filtration and column applications 
3. Environmental monitoring- Types of equipment, calibration, 
operation and maintenance; surface, air, personnel and water; 
critical work areas for aseptically filled products (ISO 5, isolators, 
etc.); surface contact, surface sanitizer neutralizing media (e.g., TSA 
w/ Lecithin & Polysorbate 80), observe sampling technique, sample 
must represent dynamic/operational conditions, and trending/CAPA. 
4. Process simulation (media fills) studies - growth promotion testing to 
include when is it performed and which microorganisms are 
included, who is responsible for reading turbidity, volume adequacy 
in the product containers and accountability of product containers 
during and after incubation periods.
5. Disinfection and sanitization- agents used (sporicidal?), preparation 
problems (over dilution); applicator (i.e., mop, spray. aerosol), time 
of exposure, areas of contact, supervision; residues, UV lights, water 
systems, filling equipment, work surfaces, process columns, 
verification and validation 
6. Room design and Equipment- accessibility for disinfection and 
cleaning; aseptic filling critical area; HEPA filter certification and 
maintenance, air flow patterns/smoke studies, change evaluation/re-
certification (rearranging cleanroom, adding equipment, HVAC, etc.), 
test during dynamic/operational conditions with maximum number of 
personnel in place, personnel and equipment flow, room differential 
pressure and temperature; adequacy of primary and secondary 
barriers 
7. Water purification and delivery system: vulnerability of distillation 
process, RO, deionizers, cartridge filters, etc.; UV lights, dead legs, 
biofilm; corrosion (heat exchangers); waterborne microorganisms 

---