Статья поступила в редакцию

ОБЗОРЫ 

---

Вопросы питания. Том 88, № 3, 2019 
37
патогенами [92]. Так, образование биопленок бактери-
ями рода Vibrio может провоцировать вовлечение в дан-
ный процесс и патогенов, таких как Listeria, Salmonella, 
Esherichia. Как и в отношении производства других 
пищевых продуктов, в рыбоперерабатывающей сфере 
биопленки наиболее часто обнаруживают на поверх-
ностях, с которыми контактирует продукция [93]. Часто 
комплекс общепринятых дезинфицирующих мер не по-
зволяет полностью избавиться от биопленок [94].
Перспективы использования полногеномного 
секвенирования для выявления 
биопленкообразующих патогенов 
Весьма перспективным представляется использова-
ние метода полногеномного секвенирования при ре-
ализации мер по предотвращению распространения 
и циркуляции патогенных микроорганизмов на предпри-
ятиях пищевой промышленности, определения путей 
их передачи в рамках эпидемиологического надзора за 
патогенами.
В настоящее время как за рубежом, так и в нашей 
стране метод полногеномного секвенирования доста-
точно широко внедрен для решения различных задач
в медицинской сфере. За рубежом данный метод начали 
использовать сравнительно недавно для установления 
источников микробного загрязнения, в том числе и био-
пленкообразующими микроорганизмами, а также для 
определения генов вирулентности и устойчивости к ан-
тибиотикам патогенных штаммов [95, 96]. Методом пол-
ногеномного секвенирования достаточно хорошо изучен 
ряд микроорганизмов, таких как Listeria monocytogenes, 
Salmonella enterica и Escherichia coli, ставших причиной 
вспышек пищевых заболеваний.
Многочисленные исследования касались и других 
патогенных микроорганизмов, выделенных из пищевых 
продуктов и объектов производственной среды. Так, 
полногеномное секвенирование Campylobacter jejuni, 
выделенных из кормов и объектов окружающей среды 
животноводческих комплексов, выявило детерминанты 
устойчивости к противомикробным препаратам [97–100].
M. Stasiewicz и соавт. показали, что L. monocytogenes, 
выделенные из объектов производственной среды, от-
личались между собой единичными однонуклеотид-
ными полиморфизмами [в среднем от 2 до 11 SNP 
(Single nucleotide polymorphism – однонуклеотидный 
полиморфизм)], и пришли к выводу, что идентичные 
или почти идентичные штаммы L. monocytogenes 
могут встречаться на разных этапах технологической 
цепочки [101]. Точно так же схожие изоляты L. monocy-
togenes были выявлены на заводах по переработке ло-
сося в Дании и Норвегии в период, охватывающий более 
10 лет, с помощью полногеномного секвенирования 
[102, 103]. Проведение метагеномных микробиологичес-
ких исследований с использованием данного метода 
дает исчерпывающую информацию о важных таксонах 
биопленки [104].